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Q. Seed culture와 final concentration에 관한 기초질문
안녕하세요. 실험초보입니다. Seed culture에 있어서 기초적인 질문 드리고 싶습니다.   Media 속 원하는 물질의 final concentration을 계산할 때, inoculate하는 seed culture의 volume을 포함해야하는지 아닌지가 궁금합니다. 이에 관해 따로 정해진 기준이 있을까요? 답변 부탁드립니다.   항상 감사합니다.
회원작성글 KEEPCALM  |  11.28
Q. 우유 속 미생물 첨부파일
공기와 차단된 상태의 우유를 가열한 후 일주일이 지나고 나서 마개를 열고 약 일주일 후의 우유 모습입니다. 우유 속에 생긴 미생물의 종류를 뭐라고 해야 할까요?
회원작성글 eunseong  |  11.28
Q. heat map , 미생물 표기 첨부파일
어떤 논문의 데이터입니다 .. gut microbiome의 heat map 결과입니다 해당분야가 아니라 잘 몰라서 질문드려요  1. 미생물 이름 표기시 앞에 써있는 알파벳의 의미가 궁금합니다. 2. 왼쪽에 나와있는 화살표? 의 의미가 궁금합니다   논무넹 언급은 없었습니다 
회원작성글 뚜리  |  11.24
Q. 대장균 한도시험, 대조시험 어디까지 해야하나요?
식품회사 미생물QC로 근무하고 있습니다. 한 샘플이 대장균 한도시험에서 EC배지 양성이 나왔습니다. 동시에 EC배지에 멸균희석액 넣어서 대조시험했고 음성나왔는데 이 다음 시험 EMB에 접종할때도 멸균희석액 넣은 음성나온 EC배지를 따서 대조시험 해야하나요?   생각해보면 이미 음성이 나온걸 가지고 EMB에 또 긁자니... 뭔가 좀 이상하고, EMB자체가 무균이라는 대조시험은 해야할 것 같기도 하구요.   다른 병원성미생물 시험은 보통 증균배양액을 대조로 분리배양배지에 접종을 해서 무균을 확인하는데   대장균 한도시험에서 EMB에도 EC배지(멸균희석액,음성나옴)를 접종해야할까요? 아님 다시 멸균희석액을 접종해야할지, 그것도 아니면 그냥 접종안한 배지를 같이 배양? 아니면 대조시험을 안해도 되는건지... 헷갈립니다. 문서로 기록을 남겨야하는 부분이라 다른 분들은 어떻게 하는지 궁금하네요.
회원작성글 yeasting  |  11.24
Q. IPTG induction에 문제가 있습니다.
안녕하세요.   현재 target enzyme을 발현하여 기능을 보고자 pET28(+)a에 삽입한 insert gene을 E.coli BL21(DE3)에 transformation하여 IPTG 1mM 농도로 induction 후 발현이 되는지를 실험중입니다. 총 3가지의 후보 target gene을 동일한 vector와 strain을 사용하여 induction하였는데 한가지 target gene은 induction도 과량으로 잘 되었고 soluble 하게 잘 발현이 되었는데요 나머지 2개의 target gene은 전혀 induction이 되지 않는것으로 보입니다. genscript를 이용하여 codon usage bias를 검토 하고자 CAI값을 확인였는데 잘 발현이 된 효소와 잘 되지 않은 효소의 CAI가 모두 0.68 ~ 0.72 수준으로 별 차이가 없었습니다.   앞으로 IPTG농도의 변화, induction 시간 변화, transformation을 다시 하는 방법등을 계획중에 있습니다.   혹시 이러한 방법 말고도 제가 확인해보면 도움이 될 요인들이 있다면 소중한 조언을 구합니다.   감사합니다.
회원작성글 SGKIM  |  11.22
Q. 발효식품에 존재하는 미생물 동정
발효식품에 Rhizopus, Aspergillus, bacillus균을 실제로 존재하는지 확인해야 합니다. 제품1. 바실러스+리조퍼스+대두 제품2. 리조퍼스+대두 제품3. 아스퍼길러스+대두 해당균을 배양해서 미생물동정은 의뢰할생각입지. 플레이트에 배양된 상태로 의뢰하라고 하는데.. 어떻게 전처리를 해야될지 잘 모르겠습니다. 단순히 백금이로 식품표면을 긁어서 pda배지에 도말해서 배양하면 되는지요? 아니면 멸균수에 희석해서 도말을 해야되는지..배양기의 온도도 궁금합니다. 혹시 곰팡이는 현미경이나 집락의 형태만으로 동정을 하기도 하나요? 고수님들 답변 부탁드리겠습니다 .감사합니다.
회원작성글 솔리드  |  11.22
Q. (고등학교 실험)손소독제에 대한 세균의 내성 확인 실험
통합과학 시간에 항생제를 자속적으로 사용하면 항생제에 내성이 생긴다고 배웠습니다. 항생제 말고 손소독제도 계속 사용하면 손소독제에 내성이 있는 세균이 생겨날지 궁금해서 실험을 해보려고 하는데 실험을 계획은 아래와 같습니다. (세균 배양기, 세균 배양 배지 등 준비물은 다 있습니다.) 1. 손소독제를 바르지 않은 손을 배지에 찍어 세균의 양을 확인한다. 2. 손소독제를 바른 후의 손을 배지에 찍어 세균의 양을 확인한다. 3. 2번 과정에서 살아남은 세균을 배양한 후 다시 손소독제를 투여한다. 4. 3번 과정에서 살아남은 세균의 양을 확인한다. 이런식으로 3 4번 과정을 반복해서 손소독제를 투여한 뒤 살아남은 세균의 상대적 수를 비교해 결과를 도출하려 합니다. 그런데 3번 과정을 어떻게 해야할지 모르겠어요. 2번 과정 후 살아남은 세균에 손소독제를 다시 투여해야하는데 배지에 손소독제를 뿌릴 수도 없고...방법이 없을까요?
회원작성글 클라인펠터  |  11.21
Q. Glucose, Fructose, Sucrose를 이용한 Yeast 알코올 발효 실험 질문 !!!!
Glucose, Fructose, Sucrose를 이용한 Yeast 알코올 발효 실험을 하였는데, 풍선을 사용해서 발효면적을 측정했거든요. 실험 결과 발효 가스 (풍선) 면적이 Sucrose > Fructose > Glucose 순으로 나타났어요. Sucrose가 가장 발효가스가 많은 이유과 Glucose의 발효가스가 가장 적은 이유는 무엇인지 알 수 있을까요? + 결과가 틀렸다면 무엇이 틀렸는지 자세히 알려주시면 감사하겠습니다 :)
회원작성글 lkhg0421  |  11.21
Q. bacteria counting CFU 계산법에 대해
e.coli를 96 well plaste에 200μL 첫칸에 μL 넣고 2~9칸에 BPS 180μL 씩 넣고 칸마다 순서대로 10^-8까지 희석을 진행하여 모든 칸에 있는 배양액 20μL씩을 배지에 접종하여 하루 뒤 관찰하였더니 10^-6 희석액?에서 77개의 colony가 관찰되어 CFU/1ml를 구하려고 하는데 얼추 구한 값이 3.85X10^9 CFU/ml가 나오는데 맞나요..?  
회원작성글 은위대  |  11.21
Q. 구강정상상재균
미생물 실험 중 병이 없는 사람의 구강에서 도말 후 Gram stain 한 현미경 1000배율 사진입니다. BAP배지, MAC 배지 중 BAP 배지에서만 자랐고, 비용혈, 포도알균으로 보이는데 정확히 무슨 균인지 알 수 있을까요?
회원작성글 콩이콩이  |  11.17
Q. 액체배지 배양에서 항생제 사용
안녕하세요 고등학교 2학년 재학 중인 학생입니다. 정말 물어볼 곳이 없어서 죄송하지만 실례를 무릅쓰고 여기에 질문합니다ㅠㅠ 제가 세균에 항생제를 사용했을 때 항생 속도를 측정하고 싶어서 액체배지에 대장균을 배양한 후에 뿌옇게 됐을 때 항생제 처리를 하고 투명해지는 경과를 관찰하려고 합니다. 그런데 이미 세균이 자랐을 때 항생제 처리를 하면 투명해지는 게 가능한가요??? 항생 속도를 관찰하려고 했을 때 제가 생각한 방법은 이거밖에 안 떠올라서요... 조언 부탁드립니다...!!
회원작성글 할수있땅  |  11.17
Q. 세균동정실험
안녕하세요 대학생입니다.    미생물공학 실험 수업시간에 세균 동정실험을 하였는데 검체가 한미약품 메디락DS였어요. 근데 동정실험의 문제점이 한미약품 메디락DS라는데 그 이유를 모르겠어요ㅠㅠ 알려주신다면 감사하겠습니다. 배지는 API 50CHB 사용했습니다.
회원작성글 릴러말티즈  |  11.17
Q. cfu용 효모 균주보관 시 연속희석 조건 관련 문의 드립니다!
안녕하세요! 배양실험 진행중인 학부생입니다. 다름이 아니라 S.cerevisiae 균주보관 조건에 대해 여쭙고자 합니다! 현재 cfu용 균주를 2일간 일정 시간마다 총 10개정도 sampling해야되는 상황이고,  cfu시에는 10^5, 10^6배 희석해 사용하고 있으며, sampling 후 도말까지 2일정도 걸립니다. 1. 지금은 sampling시에 원액을 냉장보관하고 평판도말 시 serial dilution해 사용하고 있는데, 혹시 sampling할 때 바로 serial dilution해 10^5, 10^6희석 sample을 냉장고에 보관했다가 cfu할 때 꺼내서 사용해도 균체수에 문제가 없을까요? 2. 만약 가능하다면, 지금 보관시에 YMB를 그대로 사용하고 있는데   > YMB를 그대로 / 멸균생리식염수 9 : YMB 1(균주) / 증류수 9 : YMB 1(균주)  = 어떤 조건이 가장 좋을까요? 아니면 다른 최적조건이 있을까요?   바쁘신 와중에 시간 내주셔서 감사합니다! 선배님들의 고견 부탁드립니다 ㅠㅠ
회원작성글 옆집참새  |  11.17
Q. 천연 항생 물질 실험 (알로에vs여드름 연고)
여드름연고는 내성균을 유발할 수 있으니 천연 항생물질인 알로에를 활용하면 어떨지 생각하여 알로에와 시중에서 파는 여드름 연고의 항생효과를 페이퍼디스크를 활용해 비교하는 실험을 하려는데 어려움이 있어 아래와 같은 질문을 올립니다 1. 애초에 여드름연고와 천연항생물질 중 내성균의 증식을 가속화시키는 것은 의약품인가요? 1.에 대한 대답이 긍정이라면 아래에 대한 질문도 부탁드립니다. 2. 피부에 있는 균을 채취해서 배지에 접종하고 페이퍼디스크를 추출액에 적셔 올릴 때 혐기성인 아크네균은 장비가 없는 이상 배양하는 게 힘든가요? 3. 알로에에서 항생 물질을 추출할 때 알로에 과육을 믹서에 갈은 후 거름종이로 걸러서 추출액으로 사용해도 되나요? 가루 형태의 천연 항생물질은 에탄올로 추출하는 이유는 무엇인가요? 4. 고체 여드름 연고는 페이퍼 디스크에 적시는 용도로 희석액을 준비할 때 생리식염수에 10배수 희석해서 추출액을 준비하고 액체 여드름 연고는 그대로 추출액으로 사용하는 게 맞나요?  
회원작성글 yoonhinini  |  11.16
Q. PFU 측정 double layer agar 방법에서 top agar 상태가 이상합니다. 조언부탁드립니다.
안녕하세요. 이제 갓 바이러스를 시작한 연구자입니다. 박테리오파지 MS2를 이용하는 본 실험에 들어가기 전 연습삼아 titer 측정을 하고 있는데 처음 titer 측정법을 배우며 실험했을때는 soft agar가 매끄럽게 굳고 plaque 형성도 잘 되었는데, 몇 주 후에 다시 배운 방법 그대로 연습을 시작하니 첨부한 사진처럼 soft agar 층이 매끄럽게 형성되지도 않고, control에서 plaque가 형성되지도 않고 soft agar 자체가 오돌토돌하거나 덩어리진 느낌이 있습니다. 처음엔 실수가 있었겠지 하고 다시 해봤는데 두 번째에도 이러니 답답하네요..  저희 랩에서는 LB (2.5g/100mL) + agar (1.3g/100mL)로 soft agar를 만들고 시험관에 나눠 50도 워터배스에 보관하다 사용하고 있습니다. 제가 생각하기에는 처음 배울때보다 몇 주가 지난 상태라 실내 온도가 많이 떨어져 있어 soft agar를 나눠 시험관에 분주할때나 워터배스에서 꺼낼 때 금방 식어버려 눈에는 멀쩡해보이지만 꺼내는 순간 이미 응고가 진행되고 있어 뭉치는건가 싶은데.. 제생각일 뿐이고ㅠㅠ 경험많으신 분들의 조언 부탁드립니다. 아 그리고 혹시 soft agar가 엉성하게 굳어도 plaque는 잘 생기나요..? 그렇다면 파지와 호스트 cell의 상태도 확인해야할 것 같습니다.  감사합니다.
회원작성글 Eer  |  11.16
Q. 정말 간단한 질문 ! 급해용 ㅠㅠ 농도
안녕하세요 제가 농도별로 시료에 접종 하려고 하는데, 200mg/mL로 제조된 추출액을 0.5mL접종을 하면 농도 100으로 처리 한거죠? 갑자기 헷갈리네요 ㅠㅠㅠ 균 접종도 마찬가지로 10^5cfu/ml을 0.1ml처리하면 10^4로 처리 했다고 해야하는거죠?
회원작성글 이이이여  |  11.16
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