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Q. Seed culture와 final concentration에 관한 기초질문
안녕하세요. 실험초보입니다. Seed culture에 있어서 기초적인 질문 드리고 싶습니다.   Media 속 원하는 물질의 final concentration을 계산할 때, inoculate하는 seed culture의 volume을 포함해야하는지 아닌지가 궁금합니다. 이에 관해 따로 정해진 기준이 있을까요? 답변 부탁드립니다.   항상 감사합니다.
회원작성글 KEEPCALM  |  11.28
Q. heat map , 미생물 표기 첨부파일
어떤 논문의 데이터입니다 .. gut microbiome의 heat map 결과입니다 해당분야가 아니라 잘 몰라서 질문드려요  1. 미생물 이름 표기시 앞에 써있는 알파벳의 의미가 궁금합니다. 2. 왼쪽에 나와있는 화살표? 의 의미가 궁금합니다   논무넹 언급은 없었습니다 
회원작성글 뚜리  |  11.24
Q. 대장균 한도시험, 대조시험 어디까지 해야하나요?
식품회사 미생물QC로 근무하고 있습니다. 한 샘플이 대장균 한도시험에서 EC배지 양성이 나왔습니다. 동시에 EC배지에 멸균희석액 넣어서 대조시험했고 음성나왔는데 이 다음 시험 EMB에 접종할때도 멸균희석액 넣은 음성나온 EC배지를 따서 대조시험 해야하나요?   생각해보면 이미 음성이 나온걸 가지고 EMB에 또 긁자니... 뭔가 좀 이상하고, EMB자체가 무균이라는 대조시험은 해야할 것 같기도 하구요.   다른 병원성미생물 시험은 보통 증균배양액을 대조로 분리배양배지에 접종을 해서 무균을 확인하는데   대장균 한도시험에서 EMB에도 EC배지(멸균희석액,음성나옴)를 접종해야할까요? 아님 다시 멸균희석액을 접종해야할지, 그것도 아니면 그냥 접종안한 배지를 같이 배양? 아니면 대조시험을 안해도 되는건지... 헷갈립니다. 문서로 기록을 남겨야하는 부분이라 다른 분들은 어떻게 하는지 궁금하네요.
회원작성글 yeasting  |  11.24
Q. IPTG induction에 문제가 있습니다.
안녕하세요.   현재 target enzyme을 발현하여 기능을 보고자 pET28(+)a에 삽입한 insert gene을 E.coli BL21(DE3)에 transformation하여 IPTG 1mM 농도로 induction 후 발현이 되는지를 실험중입니다. 총 3가지의 후보 target gene을 동일한 vector와 strain을 사용하여 induction하였는데 한가지 target gene은 induction도 과량으로 잘 되었고 soluble 하게 잘 발현이 되었는데요 나머지 2개의 target gene은 전혀 induction이 되지 않는것으로 보입니다. genscript를 이용하여 codon usage bias를 검토 하고자 CAI값을 확인였는데 잘 발현이 된 효소와 잘 되지 않은 효소의 CAI가 모두 0.68 ~ 0.72 수준으로 별 차이가 없었습니다.   앞으로 IPTG농도의 변화, induction 시간 변화, transformation을 다시 하는 방법등을 계획중에 있습니다.   혹시 이러한 방법 말고도 제가 확인해보면 도움이 될 요인들이 있다면 소중한 조언을 구합니다.   감사합니다.
회원작성글 SGKIM  |  11.22
Q. (고등학교 실험)손소독제에 대한 세균의 내성 확인 실험
통합과학 시간에 항생제를 자속적으로 사용하면 항생제에 내성이 생긴다고 배웠습니다. 항생제 말고 손소독제도 계속 사용하면 손소독제에 내성이 있는 세균이 생겨날지 궁금해서 실험을 해보려고 하는데 실험을 계획은 아래와 같습니다. (세균 배양기, 세균 배양 배지 등 준비물은 다 있습니다.) 1. 손소독제를 바르지 않은 손을 배지에 찍어 세균의 양을 확인한다. 2. 손소독제를 바른 후의 손을 배지에 찍어 세균의 양을 확인한다. 3. 2번 과정에서 살아남은 세균을 배양한 후 다시 손소독제를 투여한다. 4. 3번 과정에서 살아남은 세균의 양을 확인한다. 이런식으로 3 4번 과정을 반복해서 손소독제를 투여한 뒤 살아남은 세균의 상대적 수를 비교해 결과를 도출하려 합니다. 그런데 3번 과정을 어떻게 해야할지 모르겠어요. 2번 과정 후 살아남은 세균에 손소독제를 다시 투여해야하는데 배지에 손소독제를 뿌릴 수도 없고...방법이 없을까요?
회원작성글 클라인펠터  |  11.21
Q. bacteria counting CFU 계산법에 대해
e.coli를 96 well plaste에 200μL 첫칸에 μL 넣고 2~9칸에 BPS 180μL 씩 넣고 칸마다 순서대로 10^-8까지 희석을 진행하여 모든 칸에 있는 배양액 20μL씩을 배지에 접종하여 하루 뒤 관찰하였더니 10^-6 희석액?에서 77개의 colony가 관찰되어 CFU/1ml를 구하려고 하는데 얼추 구한 값이 3.85X10^9 CFU/ml가 나오는데 맞나요..?  
회원작성글 은위대  |  11.21
Q. 액체배지 배양에서 항생제 사용
안녕하세요 고등학교 2학년 재학 중인 학생입니다. 정말 물어볼 곳이 없어서 죄송하지만 실례를 무릅쓰고 여기에 질문합니다ㅠㅠ 제가 세균에 항생제를 사용했을 때 항생 속도를 측정하고 싶어서 액체배지에 대장균을 배양한 후에 뿌옇게 됐을 때 항생제 처리를 하고 투명해지는 경과를 관찰하려고 합니다. 그런데 이미 세균이 자랐을 때 항생제 처리를 하면 투명해지는 게 가능한가요??? 항생 속도를 관찰하려고 했을 때 제가 생각한 방법은 이거밖에 안 떠올라서요... 조언 부탁드립니다...!!
회원작성글 할수있땅  |  11.17
Q. 천연 항생 물질 실험 (알로에vs여드름 연고)
여드름연고는 내성균을 유발할 수 있으니 천연 항생물질인 알로에를 활용하면 어떨지 생각하여 알로에와 시중에서 파는 여드름 연고의 항생효과를 페이퍼디스크를 활용해 비교하는 실험을 하려는데 어려움이 있어 아래와 같은 질문을 올립니다 1. 애초에 여드름연고와 천연항생물질 중 내성균의 증식을 가속화시키는 것은 의약품인가요? 1.에 대한 대답이 긍정이라면 아래에 대한 질문도 부탁드립니다. 2. 피부에 있는 균을 채취해서 배지에 접종하고 페이퍼디스크를 추출액에 적셔 올릴 때 혐기성인 아크네균은 장비가 없는 이상 배양하는 게 힘든가요? 3. 알로에에서 항생 물질을 추출할 때 알로에 과육을 믹서에 갈은 후 거름종이로 걸러서 추출액으로 사용해도 되나요? 가루 형태의 천연 항생물질은 에탄올로 추출하는 이유는 무엇인가요? 4. 고체 여드름 연고는 페이퍼 디스크에 적시는 용도로 희석액을 준비할 때 생리식염수에 10배수 희석해서 추출액을 준비하고 액체 여드름 연고는 그대로 추출액으로 사용하는 게 맞나요?  
회원작성글 yoonhinini  |  11.16
Q. 정말 간단한 질문 ! 급해용 ㅠㅠ 농도
안녕하세요 제가 농도별로 시료에 접종 하려고 하는데, 200mg/mL로 제조된 추출액을 0.5mL접종을 하면 농도 100으로 처리 한거죠? 갑자기 헷갈리네요 ㅠㅠㅠ 균 접종도 마찬가지로 10^5cfu/ml을 0.1ml처리하면 10^4로 처리 했다고 해야하는거죠?
회원작성글 이이이여  |  11.16
Q. 배양배지 도말 첨부파일
학교에서 황색포도상구균을 배양하려고 황색포도상구균에 특화된 배지(오피스안 세균배양배지)를 구입했는데요, 사용 설명란에 배지를 검사 대상과 가볍게 접촉시키라고 나와있어요. 이런 경우 따로 삼분도말을 하지 않아도 되나요? 그래도 도말하는게 나을까요?
회원작성글 중학생  |  11.16
Q. 박테리아 inoculation하고 문제!!!
안녕하세요, 제가 갑자기 최근들어서 문제가 생겨서 여쭙니다. 전날 inoculation한 박테리아를 mid expo까지 키우고 난후 항생제를 투여한 후 2시간 정도 더 키워야합니다. 그런데 3일전부터 2시간 더 키우고 나서 inoculation을 확인해 보면 biofilm과 비슷하게 생긴 찌꺼기?들이 생기기 시작했습니다. 원인을 알 수 가 없어서 여기에 여쭙니다. 혹시 항생제 문제인가 싶어서 아예 새로운 stock 항생제를 사용했습니다. 혹시 비슷한 경험이나 이 문제에 대한 해답을 알고 계시면 친절히 알려주시면 감사하겠습니다.! 
회원작성글 뚜루뚜루  |  11.15
Q. 청국장균 배양에서 streaking한 선이 잘 안보이고 콜로니 크기가 제각각인데 다른균이 들어와서 오염이 된걸까요? 첨부파일
nb배지에 두번 실험했는데 두번 다 비슷하게 나왔습니다.. 1.1번에 콜로니 선이 안보이고 너무 빽빽한데 제가 streaking을 너무 촘촘하게 한걸까요? 콜로니 크기도 너무 제각각이라 다른 균이 들어온걸까요? 2. 2번 콜로니는 single colony가 너무 큰데 왜이렇게 큰 걸까요..?
회원작성글 dusel  |  11.14
Q. 한천배지를 제작하였는데 요즘 갑자기 배지 내부에 colony가 오염되어 자랍니다.ㅠ 첨부파일
대학원에서 해양미생물분류학을 전공하고 있습니다. MA 배지, ZB 배지 최소 1주일에 3-4회 제작하는데 최근 1주일동안 만들던 고체배지들에서 컨텀이 나고 있습니다. 곰팡이 컨텀이라면 가끔 본 적이 있는 일이기에 그러려니 하고 넘어가고 있는데 낙하균으로 인한 배지 표면에 생기는 colony 컨텀이 아니라 배지 내부에 콜로니가 자라는 문제가 있습니다. 배지 제작 후 멸균을 돌리기 전까지 생긴 오염일 확률은 적다고 생각하여 멸균된 배지를 붓는 과정에서 최대한 조심히 하고 있습니다.   한번 배지를 만들면 6L씩 만들곤 하는데 몇몇 배지가 아니라 저런 컨텀이 발생하면 거의 절반의 배지에 컨텀이 생기곤 합니다. 여러가지 문제점을 유추해보고 있는데 조건이 달라지지 않았더라도 컨텀이 났다가 안났다가 합니다. 첨부한 사진을 보면 흰색 콜로니가 보이실텐데 흰색에 가까운 pale-yellow pigment의 콜로니들이 배지 내부에서 자라고 있습니다. 무슨 문제일까요?   멸균은 121도에 15분 돌리고 있습니다.
회원작성글 mysonta  |  11.14
Q. 표면 세균수 측정 protocol
PVC와 스테인리스 표면에 각각 폴리페놀을 이용한 항균 코팅을 진행한 후 대조군과 표면 세균수를 비교하는 실험을 하려고 합니다. 균은 대장균과 황색포도상구균을 접종해서 사용하려 하는데, 표면 세균 수를 정량적으로 측정할 방법이 달리 생각나지 않습니다. 스테인리스 위에 액체배지를 접종해 건조시킨 후 균 검출 배지에 도장 찍듯 찍고 콜로니를 세는 방법을 써도 괜찮을까요? 더 쉽고 정량적인 방법이 있다면 추천 부탁드립니다.
회원작성글 깅스밍  |  11.10
Q. 대장균은 어떤 strain이든 cp cell로 사용가능한가요?
보통 실험실에서 클로닝 실험용으로 DH5a, BL21을 많이 사용하는 것으로 알고 있는데 클로닝에 많이 사용하는 strain들 외에 다른 strain을  클로닝에 사용해도 제가 원하는 plasmid를 얻어내는데 별 문제가 없을까요?
회원작성글 란란루  |  11.09
Q. 선생님들 E-coli titer 관련 질문드립니다.
안녕하세요.   E-coli 배양하고 있는데 궁금한 사항이 있어 질문드립니다.   현재 Seed에서 LB를 사용하고 이후 Main에서 trace와 glucose, inducer를 첨가해서 사용하는데요.   질문 1. Seed culture LB에서 키운 E-coli titer와 Main culture LB배지+trace+glucose+inducer에서 키운 titer가 다르게 나오나요? 2. 만약 다르다고 했을 시, Seed culture 레벨에서 Main media(trace, glucose, inducer)로 배양했을 시 같은 titer가 나오나요??   관련해서 실험하셨거나 아시는분 계시면 답변 부탁드립니다.ㅠㅠ 감사합니다.    
회원작성글 제야갸갸갸갸  |  11.09
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