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식물 광합성능(클로로필) 측정 |
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안녕하세요^^수중식물을 이용한 정화기술을 연구하는 초보 학생입니다.브릭 고수님들의 조언을 구하고자 이렇게 질문 올립니다. 독성물질에 노출시킨 수중식물의 효소반을 측정하려고 해서, 노출 후 액체 질소를 이용해 식물을 급속 냉각시킨 후, 냉동 보관해 놓은 상태 입니다.지금 문제가 되는 것이 제가 냉동 보관전에 광합성능을 측정했어야 하는데, 그 과정을 건너 뛰고 모두 냉동 액체 질소에 얼려버렸네요.(T.T)냉동 보관된 식물의 일부로, 클로로필 측정 시험을 진행해도 될까요>>>클로로필 측정을 위해서는 식물 분말이 필요하니, 상관이 없을것도 같은데, 궁금하네요. 전문가 분의 조언 부탁드립니다. |
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m.ha | 2011.06.21 |
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박테리아 광합성 확인 실험 |
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안녕하세요-purple photosynthetic bacteria 라고 생각되는 미생물이 정말 광합성을 하는지 확인 할 수 있는 실험이나 장비에는 어떤 것들이 있나요?CO2 고정은 못 하고.. 정말 광합성. 그러니까 광합성에 관련 된 단백질들이 정말 기능을 하는지 확인 할 수 있는 방법에는 어떤 것들이 있나요?식물의 광합성 기구들의 기능과 H+ 흐름 등등을 측정 할 수 있는 장비는 있다고 알고 있는데 박테리아에 적용 할 수 있는 그런 장비도 있나요? |
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멍멍 | 2010.08.13 |
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pBBR122_broad host range vector cloning 실험 하신분...  |
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안녕하세요.제가 이번에 받아서 실험을 진행해야할 벡터가 바로... pBBR122 입니다.다름 아니라. 제가 공대다 보니까 생물쪽에 많이 약한대요...그 동안 cloning 실험을 pET-21a 로 해봐서... 새로운 벡터 시스템에 대해 어떻게 적응할지 몰라서 이렇게 도움을 요청합니다.질문사항으로는...1. 벡터 맵에는 특별히 따로 promoter가 없는것 같은데... 그렇다면 제가 따로 넣어줘야 하는건가요? 그리고 혹시 이 때 저는 광합성 균주 (Rhodobacter sphaeroides)에서 발현을 할 예정인데요. 거기에 맞는 promoter를 해야하는건가요? 아니면 따로 벡터에 맞는 프로모터가 있는건가요?2. XL1-blue 라는 호스트(아마도 E.coli) 에 있던 pBBR122를 추출했는데... 같이 추출한 pET-21a에 클로닝된 플라스미드 양보다 반절 정도로 낮은 농도로 추출되었는데 이 벡터의 경우는 low copy 인가요? high copy 벡터라고 해야는지요? 홀직히 low 와 high copy 벡터라는 개념을 제가 잘 모르겠습니다. 따로 설명서에는 내용이 적혀있지 않은것 같습니다.3. pBBR122는 broad host range vecter 라고 써있는데요.. 그렇다면 cloning 후의 타겟유전자의 발현에는 아무런 이상없이 잘 발현되어 working하는지요?혹시 cloning 했는데.. 발현안하면.. 말짱꽝일 것 같아서..질문이 조금 많은 것 같은데요..혹시 벡터에 대한 내용은 첨부파일에 함께 올리겠습니다. 실험해보신분과 아시고 계시는 분.... 부탁드립니다. 박주용올림.3. |
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박주용 | 2010.06.10 |
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PCR& Enzyme Cut 고찰및 결과물 해석 질문입니다  |
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이번에 미생물학 전공실험으로 광합성세균과 콩과식물뿌리혹세균의 PCR&Enzyme Cut 실험으로 나온 결과물에 대한 고찰에 대해 알아보려고합니다.광합성세균은 농화배양을 거쳐 순수분리하여 G-Spin(tm) Kit로 GDNA 추출, PCR, Enzyme Cut뿌리혹세균은 28도에서 배양된 Sample을 광합성세균 GDNA추출 Kit를 사용, PCR, Enzyme Cut(둘다 Gram Negative 사용방법으로 실험)여기서 광합성세균과 뿌리혹세균 GDNA추출에서 굉장히 애를 먹었습니다.광합성세균에는 Pufm, 16S Primer를 사용하였는데 4번의 실험중 Pufm은 단 한번도 밴드에서 확인이 되지않았고 16S는 간신히 하나를 건졌습니다.뿌리혹세균에는 NODC, 16S Primer를 사용하였는데 역시 4번의 실험중 단 하나의 밴드도 확인이 되지않았고 Chelex를 사용하여 GDNA추출, PCR하여 두가지 모두 밴드에서 확인이 되었습니다.실험이 잘 안된것에 대한 고찰로 생각해본것이1. 실험에 사용된 광합성세균이 광합성세균이 아니었다? - 액체배양시 세균이 빨간색으로 변하여 광합성세균이라고 생각했었으나 실은 아니었을지도 모른다고 생각합니다.2. 뿌리혹세균은 Gram Negative가 아니었다? - 그람염색으로 확인하였는데 둘다 Negative였습니다.3. 실험의 물리적인 변동 - 도구, 실험기구및시약, 방법 등 모두 동일하였지만 여기서는 아무래도 Pipetting문제일듯합니다.두 세균 모두 Enzyme Cut 한 사진을 첨부했는데이 사진을 어떻게 해석해야할지 모르겠네요;사진 해석을 부탁드립니다. |
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Vae | 2010.06.05 |
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Q. |
계통수 작성과 homology |
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rbcL의 cds를 가지고 계통수를 그릴려고 합니다.
homology가 아닌 서열로는 계통수를 그리면 안된다고 알고 있습니다만
분명히 같은 기능을 하고 유전자명도 동일한 경우 homology가 아닌 건 이해가 안갑니다.
homology가 아닌 자료로 계통수를 그리면 절대 안되는지요?
blast2sequences로 검색하여 "no significant similarity"가 나오면 homology가 아닌 것으로
파악했습니다.
rbcL 유전자가 광합성에 필수적인 것이기에 최대한 Large-scale로 taxa를 선정하려고 합니다.
대개 염기서열길이도 비슷한데 homology가 아닌 것이 이해가 안갑니다.
무엇을 잘못하고 있는 것일까요..ㅠㅠ |
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맥콜 | 2010.05.05 |
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Q. |
cell culture 할 때 배지의 pH의 변화는? |
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안녕하세요.요즘 많이 추워지는데... 감기조심하세요.. ^^;;다름아니라...만약 cell이 성장할 때... 배지에서의 pH의 값에서...대체적으로 pH 가 떨어지는 것이 아닌가요?분명 키우는 cell 마다... 들어가는 배지 성분에 따라... 달라지겠지만...(product의 성분에 의해서..)제가 광합성균주를 키우는데...pH 가 약 pH8.0~9.0 정도가 됩니다.그렇다는 것은 광합성균주에서 생성되는 생성물에 의한것인가요?아니면.. 다른 변화에 의한 영향이 있는것일까요?어찌보면.. 유치한 질문이고 답변하기 애매한것 같다는 생각을 많이 하는데요...혹시.. 힌트라도... 뭔가 찾을 수 있을까?라는 희망에 이렇게 글을 올립니다.희망이 되어주세요. ^^ |
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박주용 | 2009.11.17 |
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PCR수행시 multi band가 뜨는이유에 대해서.. |
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최근까지도 광합성유전자 psbA gene을 증폭하기 위한 조건으로서.psbA유전자를 증폭시킨후, 그 양을 늘리기 위해서2nd round까지 수행시켰을때. 딱 원하는 싸이즈의 psbA(800bp)만 잘나왔었습니다.정말 아무런 문제없이 깔끔하게 원하는 싸이즈의 band만 떴었죠. (그게.아마 작년11월부터3월달까지 실험했을때 이 조건으로 문제없이 실험을 하였습니다.)하지만. 몇달전부터 이러한 조건에서 문제가 생기기 시작했습니다.(4월부터 지금까지요) 1st round에서부터 원하던 psbA 의 band (800bp)말고도 200bp정도의 싸이즈의 밴드가 계속 증폭이 되기 시작하였습니다.이렇게 증폭시킨 PCR 산물을 다시 2nd round 수행하였더니 1st PCR 때보다 더 진한 200bp밴드가 증폭되기 시작하였습니다. (때로는 500bp의 밴드고 뜰때도 있습니다...ㅠㅠ)이러한 원치않는 밴드를 없애고자 시약도 다시 확인해보고 프라이머도 다시 주문해서 돌려보고 PCR기계도 이상이 있는지 확인해보고. 그랬는데도. 문제가 나아지질 않네요.도대체 실험과정중.혹은 시약이라던지..어떠한 문제때문에 이렇게 갑자기 원치 않는 밴드가 형성이 되는것일까요?..제 질문에 대해서 도움을 주시면 정말 감사하겠습니다..ㅠㅠ |
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RANI | 2009.08.05 |
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광합성균 Rhodobacter, Rhodopseudomonas 분리 배양 방법?? |
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안녕하세요..
미생물학 연구실 대학원생입니다.
이번에 저희 실험실에 몇가지 균의 순수분리 method를 set up 하려고 하는데요
그 중에 Rhodobacter와 Rhodopseudomonas가 있습니다.
위의 광합성세균은 어떻게 순수분리하나요??
선택배지 만드는 법이나.. 배양 조건 등에 대하여 답변 좀 부탁드립니다..('''')(..) |
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미생물학연구실 | 2009.01.19 |
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Q. |
광합성 세균 순수분리하는 방법?? |
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안녕하세요~ 저희 실험실에서 광합성세균에 대한 실험을 하고 있는데... 액체배양은 되는데 고체배지에서 단일클로니를 얻기가 힘듭니다 ㅡ..ㅡ
실험경험이 있으신 분은 한 수 가르쳐주시길 바래요^^
- 사용하셨던 배지, 배양조건, 광원, 혐기성 조건(충진가스?)
아시는 분은 자세하게 좀 가르쳐주세요^^ 홍색비황세균 분리를 목표로 하고 있습니다... |
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윤명근 | 2008.12.01 |
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광합성 세균 순수분리 하는 방법 좀... |
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안녕하세요~ 저희 실험실에서 광합성 세균을 이용한 과제를 수행하고 있어요...
그런데 액체배양은 쉽게 되는데 고체배지에서 순수분리하는 게 어렵네요 ^^;
혹시 실험경험이 있으신분 노하우 좀 가르쳐주세요~~ 목표로 하는 균은 홍색비황세균입니다... |
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윤명근 | 2008.11.20 |
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Q. |
광합성작용에서의 이산화탄소와 산소의 상관관계 |
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넓은 잎에 엽록체가 많아 광합성 작용이 활발하다면 넓은 잎이 더 많이 이산화탄소를 흡수할것 같은데요 그렇다면 광합성작용에서 이산화탄소를 많이 흡수하면 산소 배출량도 더 많다고 할 수 있나요 즉 어떤 관계에 있는지 설명좀 해주세요.부탁드려요 |
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김수현 | 2008.11.16 |
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Q. |
광합성작용에서 이산화탄소와 산소의 상관관계 |
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광합성작용에서 이산화탄소를 많이 흡수하면 산소도 많이 배출한다고 할 수 있을까요?
한 마디로 광합성작용을 할 때 이산화탄소와 산소의 상관관계를 알려주세요. 저는 초등학생이기 때문에 조금 쉬은 말로 부탁드리고요,빠른 시일 내에 답변 부탁드립나다 |
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김수현 | 2008.11.15 |
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Q. |
식물의 잎의 넓이에 따른 초의 연소시간 |
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같은 조건이라면 식물 잎의 넓이에 따라 광합성작용이 더 활발하게 이루어지는 지 다시 말하면 산소량이 더 많이 배출되는 지에 대해 실험을 해봤다. 방법은 밀폐된 통에 잎이 넗은 식물과 초를 넣고 다른 한 통에는 잎이 좁은 식물과 초를 넣고 어느 쪽의 초가 더 오래 연소되는지 실험해 보았다. 결과는 예상대로 잎이 넓은 쪽의 초가 조금 더 오래 연소되었다. 그 이유를 과학적으로 설명을 잘 할 수가 없어서 그런데 참고 할만한 자료나 답변을 해 주시면 감사하겠습니다. 참고로 초등학생이니 너무 어려운 내용보다는 쉽게 이해될 수 있는 재미있는 책을 추천해 주세요. 그리고 가능하나 빨리 답변 부탁드립니다. |
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김수현 | 2008.11.15 |
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Q. |
잎집에서도 광합성 하나요?? |
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잎에서 광합성 하는거는 알겠는데요..
잎집이나 줄기에서도 광합성 하나요...???
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도와주세요!!! | 2008.11.05 |
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