[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
이엔셀
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
BioLab 장재봉 교수
전체보기 안전점검 LABox
 카테고리: 전체 > Omics > Genomics
Mol. Biol.-DNA Mol. Biol.-RNA Mol. Biol.-Protein Immunology
Cell Biology Microbiology Plant Biology Laboratory Animals
Omics Chemical biology Bioinformatics Laboratory Equipments
Buffer/Reagent Bioethics Etc.
카테고리 전체보기펼치기
질문/투표/프로토콜 등록
Q. Genome이나 transcriptome에서 특정 사이즈 단백질 찾기
안녕하세요?지놈 혹은 transcriptome (for eukaryote)에서 특정 범위의 MW를 갖는 모든 gene들을 sorting 할 수 있을까요?예를 들면, E. coli에서 50~60kDa 사이의 분자량을 갖는 유전자들의 정보만 추출할 수 있는 방법이 있나요?답변 부탁 드리겠습니다.
Aggies  |  2015.01.16
Q. genome sequencing 업체 추천 부탁드립니다.
안녕하세요?저는 미국의 한 업체에서 근무하고 있는 연구자입니다.저희는 주로 미생물 분리후 genome sequencing을 통해 secondary metabolites등을 연구합니다.연구가 주로 sequencing data와 그에따른 annotation data를 이용하게 되는데 한국의 업체중에 genome sequencing과 annotation을 정확하고 빠르게 제공해줄수 있는곳을 찾고 있습니다.가격도 합리적이면 좋겠구요.혹시 추천해주실만한 업체들이 있으면 부탁드리겠습니다. 한국에 이쪽으로 개인적으로 아는분이 안계셔서 이렇게 이곳에 올리게 되었습니다.감사합니다.
회원작성글 jaeheon30  |  2014.11.14
Q. chip 결과에서 tag count 가 의미하는 것..?
chip-seq에 대한 논문을 읽고 있는데그래프 해석이 도저히 안되서요.. ㅠ 아무래도 chip 에 대한 기본 지식이 없어서 그런 것 같습니다..제가 궁금한 것은,chip결과를 그래프로 나타내었을때 1. tag count2. peak3. odd ratio가 뭔가요...?그리고 왜 log2 값으로 그래프를 그리는지 모르겠습니다..그룹별로 값의 차이가 많이 날 때 그 차이를 줄이기 위해서 인가요..?하.. 너무 어렵네요 ㅠㅠ 하나라도 답변 가능한 분들 부탁드릴게요.. ㅜㅜ
학생  |  2013.10.27
Q. 에피제네틱 마커 찾는 법
요즘 에피지노믹스가 인기가 있나 봅니다.제가 요즘 정상세포와 암세포에서 메틸레이션의 변화에 대해서 공부하고 있습니다.물론 나중에는 실험도 병행할 예정입니다.정상 세포와 암세포의 에피제네틱 변화 중, DNA methylation을 보고싶습니다.이런 연구, DNA methylation은 CpG island의 methylation이 중요하며 bisulfate 법으로 PCR을 한다던가 해서 찾을 수 있습니다.그런데 시간이 촉박하다보니 여기 브릭에 도움을 청하게 되었는데요.혹시 지금까지 bisulfate 법에 사용했던 PCR primer의 서열을 정리해 놓은 사이트나 논문이 있을까요?논문을 하나하나 찾으며 준비하려니 힘이 듭니다.도와주십시요.
에피지놈  |  2012.06.18
Q. 시간별로 약물 처리 후 harvest할 때 기준을 어디에 둬야 할까요.
안녕하세요, 약물처리에 따른 유전자 변화를 microarray로 체크하려고 하는데, 약물 처리 전에 세포 media의 FBS 조성을 바꿔서 48 시간동안 처리해야 하며,그 이후 0 h, 1 h, 3 h, 6 h, 12 h 약물 처리 샘플을 걷고자 합니다. 1) 12 - 6 - 3 - 1 - 0  순으로 거꾸로 처리해서 0시간에 다 harvest하는 법2) 0시간에 동시에 다 약물처리를 해서 1 - 3 -6 -12  순으로 시간에 따라 각각 harvest하는 법    -> 그런데 이렇게 하면, 0 h인 대조군에도 vehicle을 처리해야 할텐데        vehicle을 세포에 넣자마자 바로 harvest하는 것도 웃긴것 같고,, 그렇다고         vehicle을 넣지도 않고 바로 harvest하는 것이 맞는지도 잘 모르겠습니다.3) 1 h 에 대한 v, drug/ 3 h에 대한 v, drug/ ..... 이런 식으로 각 시간마다    vehicle 처리시간을 똑같이 맞춰야 하는지..    그렇게 되면 각 시간별로 vehicle이 추가되어서 샘플수가 왕창 늘어나는데,     이렇게까지 할 필요가 있을지요..1~3번 방법 중 어느것이 가장 맞는 것인지 의견 주시면 감사하겠습니다
흑  |  2012.05.15
Q. ChIP 실험시 proteinase K 사용
ChIP 실험을 하던 중, bead 에서 elution을 마친 다음 proteinase K 처리를 잊어버리고 바로 phenol extract 후 EtOH 침전을 실시해버렸습니다.이럴 경우, 문제가 생기나요??? PCR 이 안된다든가 하는.....찜찜한 기분에   얻은 DNA에 다시 proteinase K 를 처리해서 phenol extract/EtOH 침전을 해볼까 싶기도 합니다.좀 알려주세요....ㅜㅜ
ㅜㅜ  |  2012.01.12
Q. ChIP assay 문의드립니다.
이번에 ChIP assay를 하게되었는데 우선 sonication 조건 잡는 것부터 어려움이 많네요..ㅠsonication 하고 나서 적당한 크기로 잘라졌는지 확인하려고 agarose 젤에 전기영동해서 확인하는 단계에서 DNA purification이 필요한가요?각각 프로토콜마다 다르기도 하고 거기에 관해서는 1000-500bp 사이즈가 중요하다라고만 나와있고 과정에 대해서는 자세히 나와있질 않네뇨..ㅠ 제가 듣기론 굳이 해줄 필요가 없다고 해서 우선 sonication 시킨후 centrifuge해서 취한 상등액을 DNA loading buffer와 섞어서 하고 있습니다. 그런데 결과가 잘 안 나오는데 이게 원래 그런건지 제가 방법을 잘못하고 있어서 그런건지 잘 모르겠네요..이렇게 해도 괜찮은지요?아니면 RNase나 Proteinase K같은 시약 처리 없이 phenol/chloroform extract해도 된다는 소리인지 잘 모르겠네요...ㅠ이 과정에 대해 아시면 자세히 설명해주셨으면 합니다.
므므므  |  2011.12.27
Q. Megan program 사용하신분
안녕하세요.제가 metagenomics 를 수행해서 얻은 결과를 디스플레이를 하려고 합니다.원형의 그래프 만으로는 적절치 않아서 마땅한 방법을 찾으려고보니 megan이라는 프로그램을 사용한 논문이 있었습니다.이에 저도 megan을 이용하여 display를 하려고 합니다만, 제가 한번도 사용하지 않은 프로그램이라서 어떠한 raw data가 필요한지 전혀 모르겠습니다. (phylogenic tree와 동시에 비율까지 함께 표시됩니다. 3.0 ver)혹시 사용해보신 분 계시면 comment 좀 부탁드립니다.부탁드립니다.
회원작성글 Standardbo..  |  2011.12.22
Q. 국내 micro array 서비스 대행 업체어디가 좋을까요?
gene expression 에 대한 micro arrary 하려합니다국내에서 microarray 서비스하는 업체가 많은 것 같던데혹시 서비스 받아보신분 어디가 좋을까요?
회원작성글 오늘  |  2011.11.02
Q. Empire Genomics 국내 대리점이 있나요?
Empire Genomics에서 BAC clone을 구입하려고 하는데요.shipping charge가 제품가격의 두배이상이라...혹시 국내 대리점이 있나요?아시는분은 좀 알려주요~~~
회원작성글 kgy1227  |  2010.03.02
Q. RT-PCR에서 잡히는 밴드는 모두 발현되나요?!
엄청난 문제가 생겼어요-근데 제가 분자생물학이나, genomics 쪽에 지식이 전혀 없어서 잘 모르겠어요..ㅠ일반적으로 모든 경우에서- RT-PCR에서 잡히는 밴드는 모두 발현이 된다고 봐야 하나요?!예를들어...target gene KO mouse에서 일부 밴드가 잡힌다면-발현이 된다고 봐야 하나요...?! ㅠ엄청난 고민입니다...ㅠㅜ여러분의 조언과 지식나눔 부탁드려요
KO-*  |  2009.04.03
Q. promoter assay
저는 분자생물학쪽은 초보인 연구원입니다 제가 아는 상식으로 mRNA는 5''UTR과 exon, intron 그리고 3''UTR로 구성 되어져 있고 이들이 mRNA processing을 통해서 mature RNA를 만든다고 알고 있습니다. 논문을 살펴보면 대부분의 논문에서 promoter assay를 5''UTR 앞쪽이 아닌 ATG를 기준으로 실험하고 promoter region이라고 말하던데요 제 짧은 생각으로는 5''UTR 앞쪽 부분을 promoter라고 생각하는데 저의 생각이 잘 못 된 건지?? 제가 연구하고자 하는 유전자의 경우 5''UTR과 ATG와의 거리가 50Kb 떨어져 있어서 어떤 방법으로 연구를 진행해야 할지 고민입니다. 5'' flan king region 을 enhancer region이라고 생각하고 연구를 계획중에 있습니다. 이런 경우, 제가 흥미롭게 생각하는 부분 5'' flanking region을 promoter 앞쪽에 넣어 (5''flanking region --- promoter--report gene) 실험을 진행해도 되는지요?? (제가 사용하고 있는 vector는 pGL3이로 MCS 앞쪽에 (2 Kb) salI과 bamH I이 있고 이부분에 5''flanking region 을 넣으려고 합니다. ) 제가 읽어본 논문 (Annu Rev Genomics Hum Genet. 2006;7:29-59)을 읽어보면 제가 계획하고 있는 실험으로 가능 할 것이라 생각되는데요. 저의 짧은 지식으로 처음 계획중인 실험이라 힘이드네요 선배님들의 많은 조언 부탁드립니다.
회원작성글 연구원  |  2008.08.07
Q. pRetroES vector 구합니다. 첨부파일
안녕하세요 저는 genomics에 관련된 일고 있습니다 pRetroES vector를 이용해 retrofitting BACs에 관련된 실험을 하려고 합니다. 예전에는 pRetroES vector를 atcc에서 판매 했었는데 현재는 중단된걸로 알고 있습니다. pRetroES vector를 가지고 계신 분은 연락 주시면 감사하겠습니다.
회원작성글 김수연  |  2006.08.23
Q. PathwayStudio 프로그램 관련
안녕하세요? 제가 속한 연구실에서 이번에 Ariadne Genomics사에서 개발한 PathwayStudio라는 프로그램을 구입하였습니다. 제가 프로그램사용법을 숙지하도록 계획이 되었는데요. 회사측에서 user guide를 제공합니다만 190여 pages의 방대한 양이기 때문에 혹시나 이미 사용하고 계신분이 있다면 조금 도움을 받을 수 있으리라 생각하여 글 올려봅니다. 간략한 사용법같은 것을 말씀해주시면 좋을 듯 합니다. 연락을 기다려보겠습니다. iedenkim@gmail.com 입니다.
회원작성글 김정수  |  2006.08.09
Q. 궁금한게 있습니다.
Genomics와 Proteomics에 대해 알고 싶은데 자료 찾기가 좀 힘드네요. 자세한 답변 부탁드려요~~~
학생  |  2001.09.04
Q. 이게 모죠???
genomics(제노믹스) protemics(프로테믹스) Bioimfomatics(바이오임포메틱스) 이것들이 가지는 뜻이 모죠..에효...이거좀 알아야 하는데...도저히 인터넷에서 서적에서 알길이 없내요... 생물에 대해 잘아시는분이 여기에는 많은것 같은데... 꼭 좀 저것들이 먼저 자세히좀 갈켜 주세요... 관련된 서적이나 인터넷 싸이트...등...저기에 관한것이라면 모든지 가르쳐주세요.. 그럼 부탁 드립니다..
박수형  |  2001.09.04
이전  01 02 3  다음
실험 회원 등급이란?
실험Q&A 회원등급안내
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
필코리아테크놀로지 광고