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질문/투표/프로토콜 등록
Q. 시퀀싱에서 점돌연변이가...
시퀀싱보낸 plasmid서열에서 점돌연변를 발견했는데 CGG가 AGG로 바꼈습니다. 워블법칙덕분에 아미노산이 둘다 아르기닌으로 번역되는 걸로 확인해 운이 좋았지만, 이 plasmid안의 insert DNA는 codon optimization을 진행했던거라서 번역과정에서 영향이 있지는 않을까 걱정되는데..... 그냥 써도 되나요?
회원작성글 대학원생(진)  |  01.27
Q. 금나노 합성 실험 첨부파일
항산화 효과가 있는 식물자원을 우려서(속슬렛 추출법) 염화 금산을 환원시키는 실험을 했습니다. 원래 생성된 금나노입자가 크면 푸른빛, 작으면 붉은빛으로 알고 있는데 이 사진에서 그 중간 색깔은 아직 입자가 생성되지 않은 건가요? 아님 아주 미세한 입자인 건가요?
회원작성글 다시말미잘  |  01.27
Q. H2O2농도별 IC50
안녕하세요  질문이 있어서 이렇게 글을 남깁니다.   IC50값을 구하고 western 해보려고 H202 treat하고 cell harvest해야하는데   어떻게 양을 맞추엇 만들어야할지를  몰라서요 ㅠㅠ   lM stock solution (1ml) : 102ul + 898ul   0 / 0.1 / 0.5 / 1 / 10 / 30 / 100 / 300 / 1000 (uM) 입니다....   어떻게 구하면 될까요?ㅠㅠ  
회원작성글 Skskghfh  |  01.27
Q. 뿌리에 흰 솜털 같은 것이 나는데 곰팡이 등에 의한 오염인지 알 수 있을까요? 첨부파일
사진은 감자인데 감자 외 식물에서도 간간히 보입니다. 꺼내어 만져 보니 따로 분리가 되거나 하진 않는 듯 한데 모든 감자에서 보이는 것은 아니고 20개 중 1개 정도 꼴로 발견되고 선인장에서도 발견됩니다
회원작성글 S21df1  |  01.27
Q. 직선성 실험
안녕하십니까 직선성 실험에 대해서 여쭤보고 싶은것이 있습니다 직선성이 나왔다고 판단하는 기준은 무엇인지 궁금합니다. 기울기가 1이 나왔거나 이런걸로 판단하는건가요???
회원작성글 뉴진스  |  01.27
Q. 실험실 멸균하는 이유
안녕하세요, 새내기 대학원생입니다.   다름이 아니라 실험실에서 tube, tip 등을 멸균하는 이유에 대해서 질문하고 싶습니다. 미생물을 하는 실험실은 아니고 단백질 실험을 하는 곳인데, 실험실에서 쓰는 tube을 멸균해서 사용해야 하나요?  실험실에서 쓰는 tube(멸균 안된제품)에 세균이나 균같은게 있을 수 있는지 , 있다면 멸균하는게 맞지만 있을 수 있는건지 궁금합니다. 그리고 PCR clean tube 은 멸균을 하지 않아도 되는지 궁금합니다. 감사합니다.
회원작성글 하이후아리  |  01.27
Q. ATP bioassay 과정에서의 stability에 관해 질문있습니다!!
cell을이용한 atp bio assay를 계획중입니다! cell이 죽게 되면 atp가 세포질로 나와 급격하게 분해가 이루어진다고 알고 있습니다.   cell viability 측정을 위해 cell lysis buffer를 통해 세포 내 atp를 추출하여 atp를 측정하고 하는데 이 때 추출된 atp도 급격한 분해가 이루어져서 측정에 영향을 미치는지 궁금합니다.
회원작성글 aqwasd  |  01.27
Q. 동물용 안압계 대여
안녕하세요. 석사과정 밟고 있는 대학원생입니다..   저희 실험실에서 녹내장 관련 연구를 진행하고 있는데 예산이 제한되어 있어 안압계를 구입할 수 없는 상황입니다.. 안압 측정을 통해 모델링이 되었는지 확인 해야하는데 측정을 하지 못하고 있습니다.   혹시 tonolab 같은 마우스용 안압계 가지고 있으신 분이 계시다면 하루만 대여하고 싶습니다.. 지금 모델링 해놓은 마우스의 안압만 한 번 측정하고 싶습니다..!   긴 글 읽어주셔서 감사합니다.
회원작성글 오예12345  |  01.27
Q. cell split 시 자주 media change 해주는 것이 좋은가요?
cell split 시 overnight이나 6시간 정도 incubator에 놓은 뒤 떠있는 불순물을 제거하려고 media change를 해주고, 다음 계대나 실험 전까지 incubator에서 배양하는 것으로 알고 있습니다.  목요일에 cell split 하였고, overnight 후 금요일 아침에 media change를 해주었는데, 토요일이나 일요일에 다시 media change를 해주는 것이 좋나요? 다음주에 당장 cell을 쓰지는 않고, 당분간은 계속 계대할 것 같습니다. 미천한 학부생에게 가르침을 주십시오
회원작성글 앞구르기  |  01.27
Q. NCBI에서 reference file 생성하기 첨부파일
NCBI를 이용하여 reference file을 생성하고 싶습니다. 해당 그림처럼 원하는 gene의 "intron & exon부위가 모두" cover 되도록 만드는 방법이 있을까요??
회원작성글 계란2  |  01.27
Q. RAT의 심근경색 모델링 방법 레퍼런스.
심근경색 모델을 만들어야하는데 레퍼런스나 방법을 아시는 분 있으시면 공유좀 부탁드립니다. 감사합니다. 
회원작성글 a1202601  |  01.27
Q. cell counting 하는법
세포 형광 염색 없이 cell counting 하는 경우는 없나요? 찾아보니까 imagej로 쉽게 counting 하는법은 많이 나오는데 형광 염색된 cell만 있고 실험 전 cell density를 맞출때 세포 수를 확인하는 방법이 따로 있는건가요?
회원작성글 멍게  |  01.27
Q. 최종농도 계산
100mg/ml 짜리 시약을 1mL 당 10ul로 처리 하였으면 최종 농도 몇으로 처리된건가요 ??..
회원작성글 석사감옥  |  01.26
Q. HPLC standard 제조 관련 질문드립니다.
HPLC-RI 사용 중인 학생입니다. 혼자 실험을 해야하는 상황인데 아직 미숙하여 모르는 부분이 많아 질문드립니다. 고체 분말로 된 스탠다드 물질(MW 488.44 g/mol, >=95%)을 이용하여 Calibration curve를 작성하려고 합니다. (50, 100, 250, 500, 1000, 2000 ppm) 액체 스탠다드는 ppm 계산해서 바로 희석해서 쓰면 됐는데 고체 스탠다드는 어떻게 해야하는지 감이 잘 오지 않습니다. 스탠다드 몇 g에 hplc water 몇 mL를 희석해야 하는지 한 가지 농도를 예를 들어 알려주시면 감사하겠습니다.
회원작성글 nounou  |  01.26
Q. RNA
 Melan a cell 조직에서 Trizol을 사용하여 RNA를 추출하였습니다. 조직 lysis 후 , Trizol에 chloroform을 넣어 vortexing하여 섞은 후, 몇 분 방치 한후 13000rpm 에서 10분간 centrifuge하였습니다. 4도씨에 1-3 시간 보관하고 (70% 에탄올로 washing 13000rpm 에서 10분간 centrifuge 3 번 하였습니다). 5분 건조하고 0.1% DEPC 20 μl 넣었습니다  RNA를 측정하였을때 A260/A280은 1.9정도 나오는데,  A260/A230은 2.3정도 나옵니다 ㅠㅠ.  cDNA 합성해도 될까요? A260/A280 과 A260/A230 값이 얼마정도 좋아요?  어떻게 해야 해결될지 고수님들 의견 부탁드립니다 ㅠㅠ
회원작성글 karan  |  01.26
Q. 첫 cell culture 첨부파일
안녕하세요 cell culture 처음 해보는 학부생입니다.  HEK 293 cell을 처음 연습용으로 키우고 있습니다. passage 14때 media 색깔이 노란색으로 변해서 media 교체만 해줬고 다음날 확인해보니 육안으로 둥둥 떠다니는게 보였습니다. 현미경으로 보니 저건데, 단순히 contamination된건지, 아니면 다른 뭔가 있는 건지, 저게 뭔지 알고 싶습니다... 감사합니다. 
회원작성글 빵싷  |  01.26
Q. Sodium acetate buffer 제조
효소 실험에 사용 할 acetate buffer 제조법을 찾아봤는데, 사람들마다 만드는 방식이 달라 질문합니다. 1. 1M의 sodium acetate buffer를 1L 만든다고 가정하면  1M에 맞는 sodium acetate를 800ml 정도에 녹이고  acetic acid를 이용하여 원하는 pH를 맞춘 후 나머지 볼륨을 DW로 채워 만드는 방식   2. 똑같이 1M의 sodium acetate buffer를 만들 때  sodium acetate의 몰농도와 acetic acid의 몰농도의 합이 1M이 되도록 하는 방식 이렇게 나뉘어 지는데, 둘 중 어느 방식이 옳은 것인지 궁금합니다.   개인적인 생각으론 1번 방식을 사용한다면 염기성 물질을 넣었을 때 완충 작용해줄 약산인 acetic acid의 양이 산에 대한 완충작용을 해줄 sodium acetate의 양에 비해 상대적으로 부족하지 않을까 생각하는데  이에 대한 답변도 달아주신다면 정말 감사드립니다!  
회원작성글 어허허허허헝  |  01.26
Q. 골수 그람염색시험시 배양배지
안녕하세요   골수 (bone marrow) 그람염색을 진행하는데, 프로토콜에 고체 배지에서 배양한 콜로니를 사용한다고 되어있습니다. 어떤 배지를 사용해서 몇일 정도 배양이 필요한가요?   콜로니따서 바로 슬라이드 글라스에 바르고 염색시약과정 진행하면 되는건가요?   답변부탁드립니다...!  
회원작성글 척척척척  |  01.26
Q. RM-1 cancer cell line을 구하고 싶습니다.
안녕하세요! 전립선암을 target으로 치료제를 개발하려고 하는데 마우스 암세포 cell line RM-1을 가지고 계시면 혹시 분양해주실 연구실이 계실까요??
회원작성글 이뮨프로페셔널  |  01.26
Q. rna-seq 분석 HISAT2 에러
안녕하세요, 마우스 샘플 1개 테스트를 위해 HISAT2 돌리다가 문제가 생겼습니다. 노트북(Intel(R) Core(TM) i5-10210U CPU @ 1.60GHz   2.11 GHz, 16RAM)에서 버추얼박스를 설치해 우분투에서 돌렸습니다. 아래는 제가 입력한 명령어입니다. hisat2 -p 4 --rna-strandness RF -x ./2.Input/GRCm39 -1 ./2.Input/LA50-3-CO_1_paired.fastq -2 ./2.Input/LA50-3-CO_2_paired.fastq 2> ./3.Output/LA50-3-CO_log| samtools view -@ 8 -Sbo ./3.Output/LA50-3-CO.bam 실행 1~2초후, 끝나는 느낌이고 실행로그를 살펴보면 아래와 같이 적혀있습니다. Warning: the current version of HISAT2 (2.2.1) is older than   the version (2.127.0) used to build the index. Users are strongly recommended to update HISAT2 to the latest version. Out of memory allocating plen[] in Ebwt::read() at gfm.h:6069 Error: Encountered exception: 'std::bad_alloc' Command: /home/shkim/apps/hisat2-2.2.1/hisat2-align-s --wrapper basic-0 -p 4 --rna-strandness RF -x ./2.Input/GRCm39 --read-lengths 101,97,99,98,95,93,92,90,96,94,81,91,89,88,84,83,79,75,87,82,78,76,72,70 -1 ./2.Input/LA50-3-CO_1_paired.fastq -2 ./2.Input/LA50-3-CO_2_paired.fastq (ERR): hisat2-align exited with value 1 메모리 부족문제라고 하는데, 정말 메모리 문제가 맞는지 궁금합니다. 아니면, 버추얼박스에서 돌렸기 때문인지요? 질문을 정리해보겠습니다. 1. 가상머신을 사용했기 때문인가요? 아니면, 가상머신 사용 여부와 관계없이 메모리 부족 문제인가요? 2. 메모리 부족 문제라 가정하고, 새 PC를 구입해야 한다면 어느 정도 사양이면 될까요?(완제품 우선 추천 부탁드립니다. 업체로부터 트리밍 되지 않은 raw data fastq파일을 제공받아, 분석을 시작해보려 합니다)   시간 할애해주셔서 감사합니다.
회원작성글 shh_0510  |  01.26
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