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BioWave  Vol.25, No.2 (2023년 2월) 오픈
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Mol. Biol.-DNA Mol. Biol.-RNA Mol. Biol.-Protein Immunology
Cell Biology Microbiology Plant Biology Laboratory Animals
Omics Chemical biology Bioinformatics Laboratory Equipments
Buffer/Reagent Bioethics Etc.
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Q. 전체(항생제 미사용을 말하는 겁니다) 미생물상 배양법?
안녕하세요. 개미 표면에 상주하는 박테리아 종류가 뭐가 있는지 알아볼려고 하는데요. 당면한 문제가 2가지 있습니다. metagenomics는 비용 문제로 쓰지 못하므로 관련 내용 언급은 삼가주세요.   1. 개미 표면에서 어떻게 혼합균주를 떼어낼 수 있을까요? 개미를 핀셋으로 잡아가지고 그대로 배지에 문지를 수도 없고 말입니다. 2. 1.을 해결하기 위해 한 가지 방법을 생각해 봤는데요, 다음과 같습니다. 희석한 생리식염수나 3차 증류수를 살짝 묻힌 멸균 면봉으로 개미 표면을 닦아낸 후, 그 면봉 끝을 액체배지에 담갔다가, 그 액체배지를 3일 후 다시 고체배지 위에 도말한다   인데... 뭔가 이래도 되나 싶기도 한 방법이라.... 이렇게 해도 될까요?  그리고 1. 질문도 답변 부탁드립니다.
회원작성글 jaehunjeon..  |  02.03
Q. cell doubling time 질문
안녕하세요. 세포 증식 실험을 하던 중 의문점이 생겨 질문 남깁니다. cell counting을 이용해서 cell doubling time을 구하려고 하는데  5000(0h) 4500(24h) 6800(48h) 22500(72h) 44300(96h) 24시간 주기로 세포 수를 counting 했을 때 이렇게 나왔습니다.  1. 0h-> 24h 에서 5000개를 seeding했는데 부착이 되지 않은 세포가 있는지 4500개로 세포 수가 줄었습니다. 이 때, doubling time이 -가 나오는데 이런 경우에는 어떻게 해야되는 지 궁금합니다. 2. cell doubling time을 구할 때, 0->24h, 24h-> 48h, 48h-> 72h, 72h-> 96h 각각의 doubling time을 구해서 평균을 내는 것인지 궁금합니다. 너무 기본적인 내용이지만 답변해주시면 감사하겠습니다!
회원작성글 미생이  |  02.03
Q. TOC 분석 시험 의뢰 기관 문의
안녕하세요 : )  TOC 분석 관련하여 정보가 필요해서 문의글 남깁니다.   1 ppb까지 시험이 가능한 기기로 5ppb 이하의 시험성적서를 발행할 수 있는 KORAS 분석시험기관을 서치 중입니다.    혹시 알고계시는 분 있으시면 답변 부탁드립니다.  감사합니다 : ) 
회원작성글 됴엥  |  02.03
Q. Western blot 발현량 측정 방법 질문드립니다.
안녕하세요. 공부 중에 궁금하여 질문드립니다.. 웨스턴 블롯이 타겟 단백질이 있는지 없는지 유무를 확인하는 방법이라고 이해를 하였는데요   혹시 RNA 발현량 알아보는 qPCR 실험 같이 타겟단백질의 발현량(?)을 확인하는 정량 실험은 어떤 방법이 사용되나요? 어떤 실험법으로 찾아야 공부할 수 있는지 몰라서 질문드립니다 ㅠㅠ  
회원작성글 흰털누누  |  02.03
Q. plasmid DNA transfection model, miRNA 실험 질문
reference를 찾으며 실험 모델을 찾아보다가 궁금한 점이 생겨서 질문드립니다. miRNA가 target gene의 3'UTR에 binding해서 gene expression을 조절하는 것으로 알고 있는데요. 어떤 A라는 gene이 많이 올라가 있는 상태에서 A gene억제조절하는 것을 보고싶은데 A plasmid DNA를 직접 transfection 시켜서 overexpression을 시키면 DNA에는 3'UTR이 없기 때문에 모델로서 적합하지 않은걸까요? overexpression model을 잘 안쓰고 다른 toxin으로 해당 gene을 올리는 방법으로만 쓰길래 질문드립니다. 감사합니다!
회원작성글 2밍  |  02.03
Q. western blot 시 중단할 수 있는 단계는??
안녕하세요. 저희 랩이 조마간 이사를 가게되면서 실험 장비들을 새로 셋팅을 하게 됐는데요. chemi doc이 너무 고가라 여건이 안되서 이사 전 입주해있던 곳의 장비를 사용해야 될 것 같습니다. 그런데 거리가 1시간 거리이기도 하고 거기에 연구공간도 없고 보관 장소도 없으니 필요한 물품은 직접 들고가서 장비만 후딱 쓰고 다시 복귀해야될 것 같은데,    1. blocking 단계에서 shaking 후 blocking buffer에 담가놓고 1차 항체 들고 1시간 이동. 냉장 창고에서 o/n 진행시키고 다음 날 2차 항체 들고 다시 현장으로 이동. 2차 반응/세척 후 ECL 반응시켜 chemi doc 과정 진행. (이동 중 항체에 문제가 생기지 않을지 걱정...) 2. 2차 항체 붙이고 반응 완료후 TBST에 담가놓고 이동. 현장에서 washing 마무리 하고 ECL 처리해서 chemi doc 진행 (1시간 이동하는 과정 중에 2차 항체가 씻겨나진 않을까 걱정...)    중에 어떤 방법이 더 좋을 지 알 수가 없어서 물어봅니다. 이 외에 더 좋은 방법이 있을까요??
회원작성글 민드  |  02.03
Q. cloning 과정 질문드립니다.
vector 와 insert에 enzyme cut 진행 후 ligation을 진행할려고 하는데요 2개의 enzyme를 사용하다 보니 gel 상에서 band가 2개가 나오긴 하는데 이걸 제가 원하는 size부분을 gel extraction으로 자르고 ligation을 진행하는 걸까요? 아님 그냥 진행하는 걸까요?
회원작성글 분자생물학도  |  02.03
Q. Conventional mouse에게 물리면 어떻게 될까요?
안녕하세요 Nc/Nga mouse였고 아토피 유도된 쥐였는데 꽤 깊게 물려서 피가 철철 났습니다..ㅜㅜ 걱정되어서 찾아보니 대부분은 괜찮지만 conventional mouse에게 물리면 좋지 않다고 하는데 그 이유는 무엇일까요? 그렇다면 저는 어쩌면 좋을까요? 너무 걱정됩니다... 조언 좀 부탁드립니다 선생님들..ㅜㅜ 감사합니다
회원작성글 쥐돌이귀여워  |  02.03
Q. unknown peak height가 다르게 나오는 이유
Lc-ms로 분석중인데 같은 샘플을 찍은건데 Unknown peak height가 다르게 나와요. 예를들어 보통 1로 나오던게 한번씩 3으로 나와요ㅠㅠ 이유가 뭘까요….?
회원작성글 고고고  |  02.02
Q. nitrile glove 투과도
요즘 western blot을 자주하는데 methanol이 든 transfer buffer 내에서 작업하는 과정에서 nitrile glove가 과연 100% 화학물질을 차단해주는가라는 걱정이 됩니다..! 기분탓인진 몰라도 장갑을 껴도 100% 방수가 되는 느낌이 아니라서요..ㅠ nitrile 장갑만 끼고 transfer buffer에 손을 넣고 실험을 해도 안전할까요..?
회원작성글 Labtor  |  02.02
Q. 고체, 액체 시약별 stock solution 제조
안녕하세요. 제가 너무 기초가 없네요ㅠㅠ stock solution 만들려고 하는데 시약이 고체, 액체 일때 계산하는 방법 좀 알려주세요. 각 1000ppm을 만들고 싶습니다. 톨루엔-2,4-이소시아네이트 (액체) 순도 98 % 비중 1.214 g/mL 분자량 174.16 g 페닐이소시아네이트 (고체) 순도 98 % 비중 1.18 g/mL 분자량 250.25 g
회원작성글 니팔  |  02.02
Q. Real time PCR로 해당 cell의 특정 mRNA 발현 여부
 안녕하세요, 현재 석사 과정에 있는 대학원생입니다. 다름이 아니라 real time PCR을 이용하여 두 샘플 간의 특정 mRNA 발현량을 비교하는 방법은 알고 있는데, 한 샘플에서 특정 mRNA의 발현 여부를 확인하는 방법이 어떻게 되는지 몰라 질문 드립니다.    두 샘플 비교 시, 18S, GAPDH, B-actin과 같은 housekeeping gene을 기준으로 A sample을 1로 볼 때 B sample에서는 N배 정도 더 뜨거나 덜 뜨는 것을 볼 수 있었는데 한 개의 샘플만 볼 때... 그러니까 ㄱ이라는 유전자가 ㄴ이라는 세포에서 단순히 "발현이 되는지 안 되는지"에 대한 여부만 확인할 때에는 어떻게 봐야하는지 도움 주시면 감사하겠습니다.. 감사합니다.
회원작성글 석사맨  |  02.02
Q. 전기영동 버퍼 관련 질문
아가로스겔 전기영동을 진행하려고 하고  관찰하고자 하는 핵산의 크기는 100~200bp 사이 입니다. 전기영동 할때 주로 TAE / TBE Buffer 사용하는것 같덴데  크기가 작은 핵산은 TBE로 관찰하는걸로 알고 있습니다. 실험실에 0.5X TAE 버퍼 밖에 없는데 이렇게 작은 크기의 핵산을 관찰 할 수 있을까요??
회원작성글 오리5리Oh리  |  02.02
Q. colony PCR 예상 밴드
안녕하세요 실험실 인턴 중인 대학생입니다. 콜로니 PCR 진행하려고 하는데, 실험 전 공부 중에 있습니다. PCR 진행해서 전기영동으로 내리게 될 때 뜨는 밴드가 insert gene 밴드인건 알겠습니다.   하지만 이 insert gene 사이즈를 ORF size로 봐야하는지 refseq size로 봐야하는지 잘 모르겠습니다. 예상 밴드의 사이즈를 알아야 확인할 수 있을텐데,,, 예상 밴드 사이즈를 어떻게 책정?할 수 있을까요?     답변 부탁드립니다 ㅜㅜㅜㅜㅜㅜ
회원작성글 뜌두듄  |  02.02
Q. gaussview 6.0 프로그램
안녕하세요. 실험을 진행하고 DFT를 이용하여 실험 내용을 검증하려는데 gaussview를 많이 이용하는것 같더라구요. 최신 버전이 gaussview6.0인것 같은데, 어디에서 다운받을 수 있을까요?? 무료다운은 대부분 광고인것 같고 공식 홈페이지에 들어가니 프로그램 가격이 수천달러인데...  보통 어디에서 프로그램을 다운받아 사용할까요??
회원작성글 gauss  |  02.02
Q. 세포 분화 질문입니다!!! 꼭 답변 부탁드립니다 ㅜㅜㅜㅜ
  안녕하세요. 요즘 실험 열심히 배우고 있는 학생입니다, ㅜㅜ 제가 골세포 분화 실험은 처음해보는데, 연구실에 연구원이 저 한명이라 물어볼 곳이 없어 여기 질문 올립니다.   보통 분화 실험 할 때 조건을 간단하게 적으면 - 24well plate - 5*10^4 cell seeding - 24hr 후 분화유도배지로 교체 - 2~3일 마다 배지 교체하며 2주정도 배양 이렇던데 그러면 저 정도 cell양이면 3일만 지나도 full density가 될텐데 2주동안 계속 subculture 없이 배지만 갈아주면 cell이 미어터지지 않나요? 원래 분화실험 할 때 그 정도로 full density로 진행 하는것인가요...?    기초적인 질문이지만 따듯한 답변 부탁 드립니다,ㅜㅜㅜ
회원작성글 띵똥땅  |  02.02
Q. SDS-PAGE destaining시 색덜빠짐 문제 첨부파일
안녕하세요 여러 연구원분 열심히 연구를 배우고 있는 대학원생입니다. 다름이 아니라 요즘 SDS-PAGE 실험을 하고있는데 staining 이후 destaining시 아래쪽은 색이 다 빠지는데 위쪽은 아무리 오래 빼줘도 안빠지더라구요 ㅠㅠ 무엇이 문제이고 해결방법이 있을지 조언 부탁드립니다~!!!~!~
회원작성글 돌굴러가유  |  02.02
Q. Multiplex pcr에 관하여
안녕하세요 현재 2개의 primer의 온도 조건을 동일한 온도로 각 각 확립하였고, 이후 이 두개의 primer를 같이 넣어 multiplex pcr을 진행한 결과 primer dimer 부분이 검출되어 이 부분을 보완하고자 아래와 같이 진행하였는데 나오질 않네요ㅠ 조언부탁드려요..ㅠㅠㅠ (첫 결과에서는 각 각의 primer의 bp 부분에 band가 검출되었으나 dimer 부분이 있어 수정해야했음) 변경사항 1. 기존 pcr e tube total volumn을 25 ul 에서 50ul 늘려 기존과 같은 농도(20pmole)를 가진 primer의 첨가량만 줄여서 진행 1/2배, 1/4배( 0.5ul / 0.25ul) -> 실험 결과 ; 밴드가 검출되지 않음. 이후 추가 변경 사항 1.기존 pcr e tube volumn을 25 ul 에서 50ul 늘려 기존과 같은 농도(20pmole)를 가진 primer의 첨가량 변경 1배, 1/2배, 1/4배 (1ul, 0.5ul, 0.25ul) 2. cycle 수 30->35cycle로 증가 실험결과, 1배로 넣은 곳에서 희미한 band가 확인이 됨. 하지만 band가 너무 안보임... Multiplex pcr primer의 경우 uniplex할 때와 다르게 1ul씩 넣던걸 0.5ul씩 반으로 줄여서 넣어줘야 한다고 들어서 진행을 하였으나.. 잘 안되네요 도대체...multiple pcr을 어떻게 해야 정말 잘했다는 소리를 들을 수 있는지 선생님들의 스킬을 알려주시면 너무 감사드리겠습니다... 추가로 gel 제작시 저의 경우 EtBR을 첨가해주고 있는데(4ul/100ml) gel doc 촬영시 etbr이 너무 하얗게 빛이나 사진이 안예쁘네요ㅠ 추가 꿀팁이 있다면 알려주세요!
회원작성글 해조칼슘풍덩  |  02.02
Q. mouse 또는 rat 혈압측정
폐동맥 고혈압 관련하여 in vivo 실험을 할때 우심실 수축기 혈압 (RVSP), 또는 폐동맥 혈압(PAP)이  반드시 들어가는 데이터인 것으로 알고 있는데요  측정 방법이 1. 정맥 통해서 심장으로 들어가도록 센서 있는 카테터 삽입 2. 심초음파 이용  3. 센서달린 카테터 혹은 니들을 우심실에 직접 삽입 이 3가지 방법 중에 하나인 것으로 알고는 있는데  어딜가도 자세한 방법이나 영상이 없어서요 ㅠㅠ 혹시 측정해보신 분 있으실까요?   
회원작성글 굽실굽실  |  02.02
Q. ICP-ous 를 이용한 EDTA-Pb용액에서의 Pb 농도분석 방법을 알고싶습니다
EDTA와 Pb이 complex된 용액에서의 Pb의 농도를 알고싶어 ICP-ous 를 사용하여 분석을 하고싶습니다. 기기에 sample을 주입하기 전 전처리가 필요하다고 하는데 어떤 방법이 좋을까요? 
회원작성글 Zioi  |  02.02
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