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 카테고리: 전체 > Chemical biology > Analysis
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Q. 10x TFA
안녕하세요 peptide 분석을 위해 buffer제조를 해야하는데, 10x짜리 TFA를 가지고 있습니다. 보통 peptide 분석할때 0.1% DW와 0,1% ACN을 쓴다고 확인했는데, 제가가지고 있는 10x짜리 TFA를 사용해서 buffer를 만들어야 한다면, 1L기준으로 1ml TFA+999ml DW또는 ACN으로 해서 만들면 되나요? 아니면 0.1ml TFA를 넣어서 만들어야 하나요? TFA가 10x짜리라 헷갈립니다..
회원작성글 pendoldol  |  2022.10.06
Q. HPLC TFA buffer에 대한 peak질문
안녕하세요 hplc로 peptide분석하는 사람입니다. 샘플은 peptide 단일물질을 inject 하였습니다. Gradient(A=0.05% TFA in water, B= 0.05% TFA in ACN) min A B 0 100% 0% 30 0% 100% 40 100% 0% 로 진행을 하였습니다. 근데 inject을 아무것도 하지않고 pre run을 돌렸을때, 차이가 납니다. 위에 그림에서, TFA가 없는, 그냥 DW와 ACN으로 pre run을 돌렸을떄는 아무것도 피크가 찍히지 않는데, 0.05% TFA를 넣고 만든 DW와 65% ACN buffer를 사용할때는 뒤에 계속 33분대에 peak가 뜹니다. 혹시 TFA도 hplc에서 detect이 되나요?   지금 의심되는건 이 hplc가 전에 peptide실험을 했었다고 전해들었는데, 1. column안에 TFA로만 검출되는 물질이 아직 껴있어서 33분에서 detect이 되는건지,(washing은 IPA와 MeOH, ACN을 다 써가면서 많이 했습니다..) 2. TFA가 들어있는 buffer 자체가 오염이되서 나오는건지 모르겠습니다.(필터, degasing다 했습니다!)   알려주시면 정말 감사하겠습니다!
회원작성글 닁닁  |  2022.10.06
Q. GC column flow 흔들림 원인 질문 드려요.
안녕하세요 : )  GC 장비 사용 중에 질문이 있어서 올립니다. GC Column flow가 RUN중에 다소 많이 흔들립니다. 유량제어(유량 흔들림)가 안되는것은 Sensor,Valve calibration 이외의  다른 요인이 있는지 아시는분들은 댓글 많이 남겨주세요~
회원작성글 됴엥  |  2022.10.05
Q. HPLC gradient 질문드립니다.(peptide inject)
안녕하세요. peptide sample 조건을 잡으려 하는 중입니다. 샘플은 peptide 단일물질을 inject 하였습니다. Gradient(A=0.05% TFA in water, B= 0.05% TFA in ACN) min A B 0 100% 0% 30 0% 100% 40 100% 0% 로 진행을 하였습니다. 30분까지 진행을 하고, 40분까지(10분동안) DW 100%로 하기 위해 다시 올라가는 gradient를 하였는데, 궁금한점은, 1. 0~30분사이와 30~40분사이에 똑같은 비율의 이동상이 있었을텐데, peak가 한쪽에서만 나올 수 있나요? 2. 단일물질 이어도 gradient를 하게되면 peak가 여러개가 찍히나요? 3. 2번질문에서 맞다면, 한 cycle에 나오는 모든 peak들은 다 동일한 물질이지만, 이동상에 따라 RT값만 다르게 나오는 건가요?(즉 같은 물질?이 한 그래프에 여러개가 나오는건가요?)   감사합니다...hplc 공부하는데 너무 어렵네요.ㅠ.ㅠㅠ  
회원작성글 닁닁  |  2022.10.04
Q. hplc 관련 표준편차 LOD
HPLC 분석 이후 검량선 그렸고 LOD LOQ를 구하려고 하니까 표준편차를 알아야하더라구요.. 표준편차는 이용 함수가 있던데 예시를 풀었는데 값이 다르게 나와서요.. mg/ml Average 3.9      116,769 7.8      248,327 15.625      497,272 31.25    1,024,815   농도를 계산해야하는건가요?? 표준편차 이용 함수만 사용하는거 아닌가요?ㅠㅠ
회원작성글 오늘도맑음y  |  2022.10.03
Q. (CAD-HPLC) Ghost peak 가 나타나는 원인이 뭘까요….. 첨부파일
CAD-HPLC 를 사용하여 시료를 분석하고 있습니다. 분석시간: 40min 이동상 조성: Methanol, Chloroform, ammonium acetate, acetic acid, water Column: waters C8 현재 이동상을 Blank로 사용하고있는데 Blank 를 injection 하기만 하면 9~19분대에서 약 1분 간격으로 작은 peak들이 용출됩니다. 문제는 이 작은 peak들이 나올때도 있고 안나올때도 있다는겁니다. 처음엔 Detector의 오염이라고 판단했으나 새로 들어온 장비를 사용해도 같은 현상이 발생했고, 아예 새 Column을 뜯어 사용해도 같은 현상이 발생했습니다. 의심되는건 이동상뿐인데 Methanol, Chloroform, acetic acid 모두 J.T.baker 제품을 사용하고 모두 LC grade입니다. ammonium acetate도 LC grade를 사용합니다. 시약의 문제인가 싶어서 새로운 시약으로 바꿔도 같은 현상이 나타납니다. 물이 원인일까 싶기도 했는데 같은 물을 사용해도 peak가 아예 안나타날때도 있어서 원인을 특정하기가 어렵습니다. 혹시 이런 문제를 겪어보신 분들이 계실까요?ㅠ 답변 부탁드립니다….ㅠ
회원작성글 꽃님oㅣ  |  2022.10.01
Q. 작성자 요청에 의해 삭제되었습니다.
    작성자 요청에 의해 삭제되었습니다.    
회원작성글 키티꼰쥬  |  2022.09.30
Q. 안녕하세요, 효모배양을
안녕하세요,   오늘 랩퍼멘터에다가 효모배양을 덱스트로즈로해야되는데 실수로 덱스트린을 넣어버렸습니다. 효모가 자라나요? ...
회원작성글 최진리  |  2022.09.29
Q. HPLC spike test를 진행했는데 shoulder peak가 떴는데 이건 다른 화합물인건지 궁금합니다.
HPLC를 진행하고 spike test까지 진행했는데 처음 retention time이 6.6이 나왔습니다. 그리고 spike test를 진행했을때는 retention time이 6.9 후반대가 나오고 그 전 6.6정도에서 shoulder peak가 떴습니다. 이 결과는 두 화합물이 다른 물질이라는 건지 궁금합니다.  
회원작성글 가별  |  2022.09.29
Q. HPLC Column 온도 제어 방법_RT 영향 요소 추가 문의
안녕 하세요 : )  HPLC  Column  Oven온도 관련하여 문의 드립니다.  Setting 해놓은 Column 온도에 대해 안정화 시간이 짧으면  Oven 온도가 많이 흔들리는 건지 또한 RT 값에 영향을 주는  여러 요소들에 대해 답변 주셨으면 좋겠습니다. 많이 답변 주세요 : )  감사합니다. : )
회원작성글 됴엥  |  2022.09.29
Q. 효소 저해활성 관련 질문드립니다
안녕하세요. 효소저해활성 및 kinetic 분석을 하다가 궁금한 것이 있어 질문드립니다. 전 현재 phytochemical을 이용해 alpha-glucosidase에 대한 저해 연구를 하고 있습니다. 대다수의 chemical은 저해율이 50~70%인 농도부터 4구간 정도 반수희석을 하면 저해율이 직선적 또는 곡선적인 모습이 나옵니다. 그런데 일부 화합물은 농도에 따라 서서히 오르는 것이 아니라 일정 농도에서부터 저해율이 빠르게 증가합니다.  예를 들면, A화합물: 10mM(5%), 20mM(20%), 40mM(50%), 80mM(60%) 이게 일반적인데, B화합물: 10mM(0%), 20mM(10%), 40mM(99%), 80mM(99%) 이렇게 나오는 화합물이 있습니다. 이유가 뭘까요?
회원작성글 연구직렬  |  2022.09.21
Q. 문의
안녕하세요. 해양학을 공부하고 있는 학생입니다. 그 중에서 해양생물(조개류, 게류 등 무척추동물)에 대한 공부를 하고 있는데, 그간 행동이나 간단한 처리로 결과를 도출하다가 생리 지표의 측정의 필요성을 느껴 관련한 논문 조사와 장비를 찾아보고 있는 중입니다.    우선적으로 조직 내 젖산이나 혈당을 측정하는 것을 목표로 하고 있습니다.  최근에 조개류의 조직을 고속액체크로마토그래피 분석을 맡겼더니 검출이 되지 않는 문제가 발생하였습니다.    따라서 그간 참고했던 논문을 고려하여 lactate 혹은 glucose assay kit를 사용하고자 정보를 찾아보는 중입니다.    그런데 assay kit의 경우 microplate reader가 필요하다는데 제가 알아본 가격만해도 필터 제외 700만원 수준이고 assay kit 또한 가격이 수백만원 대더군요...  한시적으로 사용하는 장비에(+제가 졸업하면 아예 사용하지 않을 것 같습니다.) 아직 테스트가 필요한 상황에서 큰 금액을 사용하는 것은 합리적이지 못하다는 생각이 들고 사실 금액도 금액이지만 kit의 경우 최소 단위가 수십개에서 100개 정도 되던데, 이것이 사용 기한이 있어 이를 기한 내 모두 소모할지도 미지수 입니다.    브릭 내 문의 게시판에서 "금액 등 현실적인 부담이 있는 경우 분석 의뢰를 맡기는 것도 방법이다"라는 글을 본 적이 있는데,    1. 해당 분석법의 경우 어떤 종류의 분석실에 의뢰를 맡기나요...? 금액을 지불하고 간단한 전처리만 거친 후 맡기는 것이 가능한 곳이 있을까요? 2. 1번과 같은 경우는 없고 만약 마이크로플레이트 분석기가 있는 곳에 맡길 경우 assay kit를 사용한 처리는 연구실에서 모두 프로토콜을 완료한 후 맡기는 것인지 궁금합니다.    생물학을 하시는 분들께는 정말 초보적인 질문일 것 같은데, 읽어주셔서 감사합니다. 
회원작성글 수비니즘  |  2022.09.20
Q. gsh standard curve
안녕하세요  현재  gsh 항산화 실험중인데, gsh standard가 찍히질 않습니다ㅠㅠ 시약 문제라기엔 같은 조건하에, 샘플은 색 변화도 보이고 발현이 확연하게 보이는데, 유독 standard curve만 아무런 변화가 없습니다.. 차이가 있다고 한다면 샘플과 다르게 standard는 상온에 두고 사용하였는데 온도 문제일까요..? 연구실 선배님들도 standard가 잘 안나온다고 하구요,,, 딱 한분만 잘 나왔는데 기존 방법과 다르게 한 것 같지도 않습니다 뭐가 문제인지 감이 잡히질 않아서 질문합니다ㅠㅠ 아시는 분은 알려주세요 엉엉
회원작성글 닉네임 짓기 힘드네  |  2022.09.19
Q. 해열성분분리 실험
헥세인과 아세트산에틸로 전개 용매를 만들었습니다. 농도를 각각 2:8 5:5 8:2로 진행을 했습니다. 분석하고 싶은 약의 종류가 극성이고 아세트산에틸도 극성이기 때문에 아세트산에틸이 많은 2:8의 비율로 실험을 했을 때 전개가 가장 많이 되는 것이 맞나요? 또, tlc의 전개 원리가 극성무극성으로 인해 생기는 것이 맞나요?
회원작성글 ㄱㅇㅂ  |  2022.09.18
Q. DPPH ASSAY 흡광도 값이 과도하게 작게 나오면
안녕하세요! 고등학생입니다.  항산화 실험을 하는 과정에서 녹차를 사용했는데요, 미숙해서 그런지 시료가 색이 진하게 나와버렸습니다. 잘 모른 상태로 흡광도를 구하였는데 너무 작게 나와버렸습니다. 시료의 색이 실험에 영향을 줄 수 있다고 하네요. 이유가 궁금해서 찾아봤는데, 시료 색이 진하면 파장이 길어져 그렇게 나오는 것이 맞나요?? 혹시 아니라면 이유가 무엇인가요??
회원작성글 Scherzer  |  2022.09.18
Q. 알칼리 표준용액 적정 시험 시 옥살산이 자주 사용되는 이유
알칼리 표준용액 적정 시험을 할 때 보통 옥살산이 자주 사용되는 거 같은데 염산이나 황산은 위험해서 잘 안쓴다고 하면 옥살산은 왜 사용되나요?
회원작성글 KHB  |  2022.09.16
Q. small molecule 구조 예측 프로그램
펩타이드를 포함한 small molecule을 디자인 하려고 하는데 solvent나 buffer에서 대략적인 구조를 예측할 수 있는 소프트웨어가 있을까요? 무료 프로그램이면 좋긴 한데 그게 아니라도 추천해 주시면 감사하겠습니다. 
회원작성글 과학하는사람  |  2022.09.15
Q. 플라스크 A, B 추출액을 모르겠어요
안녕하세요 유기화학 분별 증류 실험을 했습니다 아세트산 에틸(끓는 점 77.1) n-아세트산 부틸(끓는 점 126.1) 혼합물을 분별 증류해서 차례대로 플라스크 A, B, C를 얻었습니다. C가 n-아세트산 부틸이란 것은 알겠는데 A와 B 중 무엇이 아세트산 에틸인가요? 또 나머지 하나는 혼합물인가요? 또 수득률 계산을 몰수로 계산할 수는 없나요?
회원작성글 mmiing  |  2022.09.15
Q. 강열잔분시험에서 탄화중에 원료가 부풀어올라요
도가니에 원료넣고 기시법에 따라 황산이나 질산을 넣고 탄화시키는 과정에서  어느순간에 갑자기 거품처럼 부풀어올라서 회화를 해도 회화가 제대로 안됩니다. 황산/질산을 넣고 100도에서 50도씩 올리고 단계마다 20분간 탄화시키면서 약 400도까지 올리고 회화시키는데 어떤 과정이 문제일까요??  
회원작성글 Brleua  |  2022.09.13
Q. 흡광도 1이상
일반적인 분광광도계에서 흡광도가 1이상이 나오면 신뢰도가 떨어진다고 알고 있는데 제가 진행중인 연구 관련 논문을 보니 흡광도가 1이 넘는 경우가 간혹있었습니다 흡광도가 1이 넘어도 되는 경우가 있는건가요? 참고로 혼합물의 흡광도 측정입니다   그리고 흡광도가 1이 넘을 때는 식에 적용했을 때 일반적인 경우처럼 흡광도가 증가할수록 투과율이 감소한다는 결과가 나오지 않는다는게 맞나요?
회원작성글 dpdpdpd  |  2022.09.13
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