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『2022 하반기 연재 지정·자유 공모』 22개 주제에 대한 연재자 모집
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 카테고리: 전체
Mol. Biol.-DNA Mol. Biol.-RNA Mol. Biol.-Protein Immunology
Cell Biology Microbiology Plant Biology Laboratory Animals
Omics Chemical biology Bioinformatics Laboratory Equipments
Buffer/Reagent Bioethics Etc.
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Q. 2가지 물질의 혼합물을 uv로 측정할 때
제가 UV로 찍으려는 2가지 물질은 파장이 완전히 다르기에 서로의 피크값에 영향을 크게 주지는 않습니다 그렇지만 서로의 피크 범위에서 약간의 흡광도(0.05미만)가 존재하기 때문에 이를 보정해야 할 것 같은데요 단순히 a+b의 혼합물의 흡광도에서 같은 농도의 a의 흡광도를 빼주면 순수한 b의 흡광도가 나오는게 맞나요? 이해가 잘 안됩니다 ㅜ 도와주세요!    
회원작성글 공돌공돌  |  11.24
Q. dss유도 장염 모델은 어째서 female로도 실험하는 것이죠?
일반적으로 실험 동물 사용시 여성호르몬의 보호효과로 인하여 이를 배제하기 위해 수컷으로 실험하는 걸로 알고 있습니다. 제가 이 실험을 기획할때, DSS의 농도가 정해져있지 않아 농도확립을 위한 실험을 하여야 하고, 유도시 마우스가 희생되거나, 유도되지 않는 경우도 많다는 것을 확인하고 암컷이 DSS에 저항성을 가져 보다 높은 농도에서 유도되며, 수많은 논문에서 암컷을 실험동물로 쓰는것을 확인한 후, 암컷으로 실험을 진행하였습니다.  그런데 왜 수컷으로 실험하지 않았느냐는 질문이 들어왔을 때 대답할 수 없었습니다. 생각해보면 여성호르몬의 보호효과는 사라지지 않았고, 심지어는 estradiol이 보호효과를 보인다고 논문화 되어있더군요. 실험에서는 변수를 줄이는게 기본이고.. 그래서 암컷 사용을 지양해야 하는데도 불구...  이런 기본적인 문제가 존재함에도 어째서 암컷으로 실험한 논문이 많은지 그 이유가 궁금합니다.   
회원작성글 caco2  |  11.24
Q. COD수질오염키트 원리및시약
역반응또는 크롬망간인가...? 했는데 서치해봐도 나오질 않네요 관련정보는 어디서 찾을 수 있을 까요 ㅜㅜ
회원작성글 cocoyaj  |  11.24
Q. heat map , 미생물 표기 첨부파일
어떤 논문의 데이터입니다 .. gut microbiome의 heat map 결과입니다 해당분야가 아니라 잘 몰라서 질문드려요  1. 미생물 이름 표기시 앞에 써있는 알파벳의 의미가 궁금합니다. 2. 왼쪽에 나와있는 화살표? 의 의미가 궁금합니다   논무넹 언급은 없었습니다 
회원작성글 뚜리  |  11.24
Q. Transformation bead
Transformation 할 때 bead로 굴려서 spreading 하는데 이때 노하우가 있을까요? colony가 자꾸 잘 안떠서... shaking하다가 cell들이 많이 죽을 수 있는지, 어느정도 해야될지 감이 잘 안잡혀서 도움 요청합니다..
회원작성글 쪼꼬만먼지  |  11.24
Q. Site-directed mutagenesis 안되는 이유..
  안녕하세요.. 현재 Site-directed mutagenesis를 하고있는데 colony가 안떠서 난항을 겪고 있습니다..   vector 전체 size는 3.5kb로 작은 편이고, primer design은 다음과 같이 C ▶ T로 바꾸는 것을 목표로 하여, 33mer 로 design 하였습니다.   snapgene 상에서의 Tm값은 63도로 계산되나, 사실 primer 자체는 Agilent quickchange webdesign tool로 design 한 것입니다.    Agilent quickchange protocol은 annealing Tm 값을 55도 기준으로 한다는데.. 무튼 protocol은 다음과 같이 하였습니다..   PCR mixture : total volume 50ul (high fidelity Pfu)에 template vector 200ng PCR cycle :    95°C 30s 95°C 30s 55°C 60s 68°C 2:30s (1kb/30s로 조금 넉넉하게 줬습니다.) step 2부터 X 18  68°C 13:00   PCR이 완료되면, 바로 PCR product에 DpnI 1ul 넣고 37°C 에서 6h incubation    그리고 com-cell에 heatshock 주고, 1ml plain LB에서 40min 돟안 shaking incubation   마지막으로 1ml LB culture medium centrifugation 하여, 가라앉은 com-cell pellet과 soup조금만 남기고, 적당히 pipeting하여 suspened하게 만들고 Amp(marker입니다.) plate에 spreading       제가 예~전에 해당 protocol로 했을 때는 잘 했었던것 같은데, 그때랑 달라진건 polymerase 종류 (회사) 정도? 그래서 사실 high fidelity Pfu 다른 회사 2종류로 test 해봤는데도 역시 안뜨더군요..   무엇이 문제일까요...   선생님들의 지식을 조금만 나누어주시면 감사드리겠습니다.. ㅠㅠ
회원작성글 neuronal p..  |  11.24
Q. retinoic acid 응결 현상 해결방법
안녕하세요. 지금 retinoic acid를 이용해서 SH-SY5Y 분화 실험 셋업중인 석사 1학기차입니다.   지금 5mM retinoic acid stock을 만들어둔 상태이고요. (DMSO에 녹였습니다!) media(DMEM)에 희석시켜서 최종 10uM 사용하려고 했는데 RA가 잘 안녹고 떠다니더라구요 ㅠㅠ  그리고 최대한 vortexing하고 처리해봤더니 cell도 다떨어져 죽었습니다.. 같은양의 DMSO만 넣었을땐 안죽는걸로 봐서 RA 때문인거같은데.. 혹시 SH-SY5Y분화실험을 해보셨거나 RA를 완벽하게 녹이는 법을 알고계신분 있을까요..?
회원작성글 청포도맛 망고  |  11.24
Q. assembly PCR
안녕하세요 assembly PCR이 너무 안되어 질문 올려봅니다... 두 gene을 10cycles을 돌려 assembled fragment를 확보하고(gel extration도 이용해봄) 다시 primer를 넣어 amplify를 시도하는데 계속해서 원래 두 개의 gene이 분리되어 나옵니다.. method의 문제로 일어나는 일 일까요?  첫번째 사진이 10cycles 후 사진이고, 두번째는 첫번째의 네모박스 사이즈의 dna를 gel extraction으로 분리 후 primer와 함께 amplify 한 사진입니다      
회원작성글 CYS  |  11.24
Q. 동물세포주 보관온도에 대한 정보를 공유부탁드립니다.
동물세포주 보관시 LN2 탱크 Vapor 상태로 보관을 하게되는데요 LN2 탱크의 제조사도 -180ºC로 Vapor공간의 온도가 유지된다고 설명하고 관리되어오고 있는 기준도 -180ºC로 관리를 하고 있습니다. 세포주 용기 제조사에서는 오염이나 기타 문제로 인해 Cryogenic vial을  액체질내 내에 보관은 권장하지 않으며, 액체질소탱크 제조사 역시 액체질소내에 제품 보관하는 것을 권장하지 않습니다. 그렇다면 동물세포주 보관온도는 몇ºC에서 보관하는것이 좋은지, 그에 따른 근거 기준은 무엇인지 궁금합니다. 알고계신분이 계시다면 알려주세요. 많은도움이될것같습니다. 감사합니다.
회원작성글 ASJN  |  11.24
Q. 대장균 한도시험, 대조시험 어디까지 해야하나요?
식품회사 미생물QC로 근무하고 있습니다. 한 샘플이 대장균 한도시험에서 EC배지 양성이 나왔습니다. 동시에 EC배지에 멸균희석액 넣어서 대조시험했고 음성나왔는데 이 다음 시험 EMB에 접종할때도 멸균희석액 넣은 음성나온 EC배지를 따서 대조시험 해야하나요?   생각해보면 이미 음성이 나온걸 가지고 EMB에 또 긁자니... 뭔가 좀 이상하고, EMB자체가 무균이라는 대조시험은 해야할 것 같기도 하구요.   다른 병원성미생물 시험은 보통 증균배양액을 대조로 분리배양배지에 접종을 해서 무균을 확인하는데   대장균 한도시험에서 EMB에도 EC배지(멸균희석액,음성나옴)를 접종해야할까요? 아님 다시 멸균희석액을 접종해야할지, 그것도 아니면 그냥 접종안한 배지를 같이 배양? 아니면 대조시험을 안해도 되는건지... 헷갈립니다. 문서로 기록을 남겨야하는 부분이라 다른 분들은 어떻게 하는지 궁금하네요.
회원작성글 yeasting  |  11.24
Q. R2A와 Marine 배지의 차이점이 무엇인가요?
해수 미생물을 접종하려고 하는데 R2A broth 배지로 스탁 만들어져 있던 걸 R2A 배지가 없어서 Marine 배지에 다시 접종해야 한다고 하네요. 이전에는 R2A 배지와 Marine 배지 구분해서 사용했는데 둘이 어떤 차이점이 있을까요?
회원작성글 실험실애기  |  11.24
Q. 해양식물플랑크톤을 이용한 macromolecule(lipid) production
 안녕하세요. 해양학을 공부하고 있는 학생입니다. 다름이 아니라 해양식물플랑크톤을 이용해서 거대분자 중 지질에 초점을 맞추어 production 실험을 진행하기 위해 공부중인 상황입니다.  그런데 이에 대한 논문을 찾는 과정 중에 어려움을 느껴 질문드립니다.   phytoplankton macromolecule production, phytoplankton lipid production 등 다양한 키워드를 활용해서 검색을 해보았지만 원하는 논문이 잘 나오지 않았습니다. 실험 method 부분이 자세히 서술되어 있는 논문을 찾고 싶은데 어떻게 검색을 하면 원하는 논문을 좀 더 잘 찾을 수 있을까요?  해당 논문을 검색할 수 있는 방식이나 혹시 추천해주실 만한 논문이 있으면 추천해주시면 감사하겠습니다. 
회원작성글 말랑복숭아  |  11.23
Q. Rat PK 문의
현재 약물 A를 분석법 셋업 후 Rat PK 진행 중에 있습니다.   PO 부형제는 MC+0.05%Tw20(Sonication/vortexing)으로 진행 하고 있습니다.   예비 시험을 통하여 대략 지속적으로 Cmax 1000ng/mL이 나왔고, 본 시험 진행 하였습니다. 본 시험 결과 Cmax 1ng/mL 수준으로 확인이 되었습니다. 이후 반복 시험을 진행 하였지만 1ng/mL이상이 나오지 않고 있습니다.  동물 담당자도 지속적으로 반복 진행 하였으며, 혹시 몰라 다른분에게 진행 부탁을 하였으나 결과는 낮게 측정이 되고 있습니다. 분석 부분에서는 직선성을 지속적으로 확인 하였고, stock solution도 다시 만들었지만 분석상의 이슈는 없어 보입니다. 근데 IV는 잘 나옵니다. ㅠㅠ   정리: IV 투여 시 이슈 없음 PO 투여시 대략 1/1000으로 감도 저하 관련 소모품은 다시 조제 하였습니다.   관련 하여 혹시 문제가 될만한 내용이 있을까요?   답변을 주실분이 계시다면 감사하겠습니다. ㅠㅠ    
회원작성글 초심자  |  11.23
Q. cDNA 합성에서 헷갈리는 부분이 있습니다.
RNA template에서 oligo dT나 random hexamer와 Reverse transcriptase를 사용해서 RNA-DNA helix를 생성하고 RNase H를 사용해서 RNA만을 분해한 다음(ssDNA만 남고), DNA polymerase로 dsDNA로 합성해준다고 알고 있습니다. 그런데 여러 회사에서 파는 cDNA 합성 kit에는 왜 DNA polymerase가 없는 건가요? 그냥 RNA-DNA helix를 PCR에 사용하는 건가요?   그리고 저희 실험실에서는 Bio-RAD의 iScript cDNA synthesis kit를 사용하는데, 여기서 제공되는 RT는 RNase H+라고 하더군요 근데 RNase H는 RNA를 분해한다고 하는데, 그럼 최종 합성 prouct가 sscDNA로 남는걸까요?  
회원작성글 ziiion  |  11.23
Q. 세포 오염(Contamination)인가요?
  안녕하세요. 대학원 석사생입니다. 세포를 키우는데 어느날 곰팡이가 활짝 피어서 인큐베이터 뒤집고 다시 세포를 풀었는데 세포 상태가 좋지 않아 배지만 갈아주고 다음 날 확인하였습니다. 더 자라지 않고 세포 모양이 변한거 같은 생각이 듭니다. 또 자세히 보니 세포 주변에 이런 것들이 있어서 그런데 세포가 또 오염된걸까요? 원인을 알려주셨으면 합니다. 감사합니다.
회원작성글 댕댕박사  |  11.23
Q. (Cell Apoptosis)Annexin5 staining 후 4'C에 잠시 두어도 괜찮을까요?
  안녕하세요, 저는 현재 석사 반년차 대학원생입니다.   약물 처리한 Cell을 이용해 Annexin5로 staining 진행하고 Cell Apoptosis를 관찰하는 실험을 계획하고 있습니다.   Apoptosis가 진행되는 과정을 보는 것이라 되도록 빠른 시간 안에 측정하는 것이 좋다는 것은 알고 있지만,   해당 실험 계획한 시간에 다른 일정이 생겨, Annexin5 staining까지만 진행하고 실험을 잠시 멈춘 뒤(우선 테스트 겸 진행해보는 실험이라서요), 2시간 정도 뒤에야 재개할 수 있을 것 같습니다. 이때 Staining한 Cell을 Tube에 두고 4'C 냉장고에서 보관해두어도 될까요?   아니면 staining전 Cell pellet만 얻어서 냉장고에 넣어두고(약 두시간) 일정 마친뒤에 staining을 진행하는 편이 나을까요?   2시간 사이 Cell이 다 죽어버릴 확률이 커서 측정할 가치가 없다고 판단되면 그냥 실험 스케줄을 다시 잡아볼 생각입니다..Cell 상태가 어느정도 유지될 가능성이 있다고 하면 진행해볼 계획이구요.   관련된 실험 경험이 있으시거나 해답을 아시는 선배님들이 계시다면, 답변 주시면 감사드리겠습니다..!ㅜㅜ          
회원작성글 HEHE  |  11.23
Q. 클린룸 소독제 에탄올 vs 아이소프로필알코올
클린룸 관련하여 사용되어지는 70%에탄올과 70%IPA(아이소프로필알코올)에 대하여 차이점이 무엇인지 궁금합니다. 둘다 일반적인 소독제로 주기적으로 사용이 되어지고 있는걸로 아는데 균 소독을 하는데 있어 더 강하여서 IPA를 사용하게 되는건지 냄새가 강해 에탄올을 사용하는건지 등 특정한 차이점이 있는지 알고 싶습니다.
회원작성글 땡띵  |  11.23
Q. pvpp녹이기
열수추출물에 pvpp넣어서 녹여야 하는데 안녹아요 어떡하죠?
회원작성글 사즈아  |  11.23
Q. 녹말 표준곡선
분광광도계를 이용해서 녹말 표준곡선을 만들려고 하는데 표준화된 실험방법이 적힌 자료가 있을까요… 지난번에 실험했었는데 (녹말 농도를 달리 해서) 결과가 완전 이상하게 나와서 (흡광도 그래프가 들쭉날쭉.. 곡선 형태가 안 나와서요) 다시 해야 할 것 같아요.. 아직 고딩입니다 ㅠ
회원작성글 캐츠  |  11.23
Q. 물질 농도에 따른 부피 계산 질문드립니다.
  어떤 물질 stock 1mM 인데요. 이 물질을 0.1uM로 희석한 양을 500ul을 만들려고하는데요. 이 계산식이 맞는지 검토좀 부탁드립니다. working concentration / stocking concentration x total volume = stocking 물질을 얼마나 넣어야 하는지에 대한 volume 따라서, 1mM (=1,000uM) 이므로, 0.1uM / 1,000uM x 500ul = 0.05ul 맞나요??
회원작성글 medi92  |  11.23
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