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Q. |
LC MSMS에 LC MS 분석법 적용 및 LC MS mobile phase |
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1. lc msms 기계에 ms분석법을 적용할 수 있을까요?
이정도의 Parameter만 있으면 분석이 가능한건가요?
2. ms에 mobile phase로 인산염 완충액을 사용해도 될까요?
3. API-ES라는 말은 ESI, ACPCI와 같은 이온화 방식의 하나일까요?
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연구초보생 | 03.30 |
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Q. |
cell media 문의 |
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cell stock에 문제가 있었어서 penicillin 없는 DMEM media+10% FBS 인 media를 만들어 일주일 전에 한번정도 사용했는데,
다시 새로운 cell을 분양받고 새로운 DMEM +10% media+ 1% penicillin을 사용하여 배양중에 있습니다.
이전에 썼던 penicillin이 없는 media에 추가로 penicillin을 넣어 사용해도 배양할때 cell 상태에 문제가 되진 않을까요?
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망고두지 | 03.30 |
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Q. |
EGFR wild type- primer design |
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안녕하세요.
A549 cell을 이용하여 EGFR-WT을 detect을 하고 싶은데,
NCBI에서 EGFR-WT PASTA 정보를 찾기 어렵네요,,,
A549 cell로 부터 DNA extraction을 진행 후 EGFR-WT primer를 디자인해 PCR을 진행할 예정입니다.
감사합니다.
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minzero | 03.30 |
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Q. |
부유세포 |
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안녕하세요. 이번에 COLO-205세포를 분양받게 되었는데 부착세포만 키워봐서 부유세포에 대한 지식이 많이 부족합니다.
1. 혹시 부유세포를 100파이, 150파이 디쉬에 키워도 괜찮은 건가요? 선배 중 한 분이 디쉬에는 코팅이 되어있어서 부유세포를 키우기에 적합하지 않다고 하는데 flask와 많이 차이가 있는지 궁금합니다.
2. wash는 상층액 일부를 갈아주는 형식인가요? 배지를 일부 suction 후 새 배지를 채워주면 되는 것인지 궁금합니다.
3. 부착세포는 sub할 때 TE처리를 하여 세포를 모은 후 centri를 돌려 진행을 하였는데 부유세포는 TE처리를 할 필요가 없는 건가요?
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jang0101 | 03.30 |
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Q. |
HPLC base line 들뜸 현상 |
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안녕하세요 hplc로 정량하고 있는 와중에
그저께부터 베이스라인이 들떠서ㅜㅜ 정량을 못 하고 있습니다,, 정량해야 할 피크가 자꾸 base line이 들떠버리는 곳에 포함되어 있어 정확하게 정량을 할 수가 없습니다.
5분까지 15% ACN
35분까지 15-50% ACN으로 올려주는데,
30% ACN쯤 되면 베이스라인이 바로 뜨더라구요
혹여 시료 농도 문제일까 싶어 농도, injection 양을 다 바꿔보았지만 그대로입니다ㅠㅠ
혹시 해결방법 아시는 분 계실까요ㅠㅠ |
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쿼카는 | 03.30 |
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Q. |
MALDI Sample Prep을 위해 시료를 Serial Dilution할 때, 최종 부피로 Matrix도 고려해야하나요? |
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안녕하세요!
MALDI TOF를 이용해서 Mass 분석 실험을 진행하려고 합니다.
DNA 시료를 농도별로 희석해서 MALDI에서 찍어볼려고하는데,
최종부피에 Matrix 부피까지 고려를 해서 희석해야하나요?
예를들어, 내가 0.8%의 DNA 수용액을 가지고 있고
이를 총 부피 100uL로 10배 묽히고자 할 때,
DW(Diluited Water) 90 uL + DNA Sample 10 uL 를 혼합 해 최종 Sample 희석액을 만들잖아요?
근데 마지막에 Matrix와 Sample 희석액을 1:1 비율로 섞는다면, Sample 희석액의 전체 부피가 변하니까 농도도 하지 않나 하는 것이 저의 우려입니다.
MALDI 실험을 위해 전처리를 처음해보긴 하는데,
보통은 Matrix와 섞을 때의 부피는 고려를 안해주는게 맞나요, 해주는게 맞나요?
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apple84 | 03.30 |
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Q. |
cell 길이 측정 / C2C12 분화도 측정 |
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C2C12 cell을 Horse serum 첨가 배지에서 myotube로 분화시키며
몇일간 분화를 시킬지 조건을 잡고 있는데요.
논문을 찾아보니 분화된 myotube의 길이와 직경 같은 것을 그래프화 시켜서 분화조건을 뒷받침 하는 자료로 쓰기도 하시더라고요.
그런데 논문에는 어떻게 직경을 측정했는지에 대한 자세한 내용이 없어서
cell의 길이나 직경을 어떻게 측정하고 그래프화 시키는지 여쭤보고 싶습니다.
따로 cell 길이나 직경을 측정해주는 기계가 있는 건가요 ?
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솔미솔 | 03.29 |
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Q. |
열고정으로 인해 죽은 균 |
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찾아보니 죽은 균을 염색하면 현미경으로 관찰이 가능하다고 하더라구요. 그렇다면 염색을 하지 않으면 관찰이 안되는건가요? 아예 투명해서 안보이게 되는건가요?
그람염색 실험 후 마지막에 그람 양성균은 관찰이 아예 안되고, 그냥 무색의 탈색된 음성균만 관찰이 됐습니다. 대조염색 안된건 둘째 치고 양성균이 관찰 안된 이유를 저는 열고정할 때 다 사멸해버린 것으로 예상하고 있습니다. 만약 이 가설이 맞다면 왜 탈색된 상태의 음성균은... 관찰이 된거죠? 양성균이 죽어버릴 정도의 온도였으면 음성균도 죽어서 보이지 않아야 하는거 아닌가요....? |
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으아악악 | 03.29 |
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Q. |
RNA gel 좀 봐주세요  |
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안녕하세요
Bacteria (E.coli)에서 RNA extraction을 진행하였습니다.
TE buffer+Lysozyme+RNAse inhibitor를 넣고 lysis를 했고,
마지막에 RNA elution시에도 RNAase inhibitor와 EDTA를 추가했습니다.
샘플은 총 두 가지로 각각 다른 E.coli strain이었고
DNA digestion과 clean-up 후 260/280은 앞의 밴드 샘플이 1.82 두번쨰 밴드 샘플이 2.04였습니다.
일반 agarose gel에 로딩하였는데(2%사용_첫번째샘플:3ug, 두번째샘플:7ug), 밴드 두 줄이 나온 두번째 샘플과 달리 첫번째 샘플은 degradation이 된 것 같습니다.
첫번째 샘플에 대해 질문 있습니다.
1.gDNA 밴드가 나온 것으로 봐서 lysis는 된 게 맞지요?(DNA digestion 전에는 gDNA밴드만 상당히 굵게 나왔습니다)
2.RNAse inhibitor양을 늘려야할까요?
3. DNA digestion 했는데도 gDNA 밴드가 나오는 이유가 뭔가요? incubation time을 늘려야할까요?
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pjy25n | 03.29 |
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Q. |
TLC 에 대하여 질문 있습니다. |
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TLC를 이용하여 균의 배양액 어떠한 물질들이 있는지 대략적으로 알아보고자 합니다.
하지만 crude extract이기에 무수히 많은 물질이 있어 어떤 이동상을 써야할지 모르겠습니다. 딱히 타겟하는 물질이 있는 것도 아니며, 단순히 얼마나 많은 종류의 대사산물이 있는지 보고자 하는 것입니다. 제가 여쭈어보고 싶은 것은
페놀, Alkaloids, terpenoids등등.. 계통 별로, 즉 chemical별로 이동상에 사용되는 용매의 종류가 결정되는 것인가요??
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김소현이다 | 03.29 |
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Q. |
mouse 약물 주입 후, 혈청분석 할 때, 오래 지나면 파라미터 의미가 없어지나요? |
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안녕하세요
현재 mouse xenograft model에서 약물주입 후, 약물에 대한 독성을 같이 확인하고자 하는데, 약물주입 후, 4~6주 후에 안락사 시킨 후, 장기와 혈청을 분석하고자 해요
그런데 혈청 관련해서 AST나 CK 같은 파라미터를 보고자 하는데, 약물주입이 끝나고 4~6주가 지났어도 혈청 분석시 유의미하게 데이터가 나올 수 있나요?
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Viiiiiii | 03.29 |
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Q. |
pcDNA3.1-PCDH10 vector 소지하고 계신분 구합니다! |
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혹시 pcDNA3.1-PCDH10 vector을 가지고 계시는 랩실이나 개인 있으신가요? 진행하는 연구가 있어 꼭 필요하게 되어 구해봅니다.. 있으신분들은 개인쪽지나 댓글 남겨주시면 연락드리겠습니다... 소지하고 계신분들에게 부탁드리며.. 사례도 하겠습니다... ㅠㅠ
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연성 | 03.29 |
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Q. |
MALDI TOF MS 측정 후 데이터 분석 시 |
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Oligonucleotide의 MALDI TOF MS 분석과 관련하여 문헌조사를 하는 중입니다.Oligonucleotide 합성도 처음이고 MALDI도 처음이라 좀 시행착오중이긴한데
그 과정에서 궁금한게 생겨 질문 글 올려봅니다.
아래와같이 올리고의 합성에 따른 과정을 MALDI TOF로 찍어봤을 때
Detritylation에 따라 5'의 보호기인 DMT가 떨어지는건 알겠는데,
1. 그렇다면 Mass를 나타낸 우측 결과에서는 d1 부분에대해서만 -DMTr을 해주면 될텐데 왜 d2,d3도 모두 -DMTr을 해줘서 질량값을 나타내나요???
2. Main Peak 외에 Small Peak의 질량에 대해서는 그냥 부산물이겠거니 하고 무시해도 되는 건가요?
(예를들면, Coupling 하고 나서의 Mass Peak을 보면 1226.6 옆에 1242.4, 1264.8 등의 마이너한 Peak들)
답변부탁드립니다!!!!
(참조 논문: NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS, 20(4–7), 951–954 (2001))
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apple84 | 03.29 |
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Q. |
western 실험시 streptavidin-HRP 사용에 관해 질문이 있습니다. |
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안녕하세요
biotinylation된 단백질을 western으로 detection하려고합니다.
저는 streptavidin 1차 안티바디를 쓰고 웨스턴을 하려고했는데
streptavidin 자체에 HRP가 달린 제품도 있더라구요
이 제품사용시에는 1차-2차 안티바디 반응없이
transfer가 끝난 membrane을 streptavidin-HRP으로 incubation을 해주고 바로 ECL과 반응하면 되나요?
만약에 이 방식이 맞다면 원래 쓰는 antigen-antibody보다 과정이 줄어들어 편할 것 같긴한데 효율도 좋을지 여쭤보고자 글을 써봅니다.
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열심히 하자 | 03.29 |
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