실험 Q&A Mol. Biol.-RNA > Northern Blot
nothern과 RT-PCR
석사생 (비회원)
노던과 rt의 차이점은 알고 있습니다만... paper를 찾아 보던중, 노던으로 rna가 발현되지 않음을 알고 같은 cell line을 구해서 rt를 해본결과 밴드가 상당히 많이 잡힙니다. 제가 control로 사용한 cell line(이 cell line은 nothern 발현이 상당히 많이 되어 있네요) rt가 노던보다 상당히 sensitive하여 자칫하다가는 상당히 짙은 밴드가 잡힌다고 합니다만... 노던에서조차 보여지지 않았던 밴드가, 노던에서 상당량 발현이 확인된 cell line에서보다 더 밴드가 진하게 나오는지... 설명좀 부탁드리겠습니다. rt의 목적에 부합하여 유전자 발현의 상대적 패턴을 보고자 함인데 당황스럽습니다. 제 실험계획을 노던 data를 바탕으로 계획해서 진행중이었는데 막상 rt를 하고보니 정 반대의 결과를 보여주고 있어서 어떻게 해석해야 할지 모르겠습니다. 도움 부탁드립니다. (노던 데이타가 실린 paper는 중상정도급의 paper입니다) - 다시 정리하자면, 노던에서 detection되지 않았음에도, RT-PCR 에서는 detection된다. 노던에서 과량 detection되지만, RT-PCR에서는 노던시 detection되지 않는것 보다 상대적으로 detection되는 양이 적다. 입니다.
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