님은 electroporation을 하고 계십니다.
Molecular Cloning을 보세요.
아니면 여기 BRIC 실험에 찾아보면 chemical transformation 방법이 잘 설명되어 있습니다.
Inoue 방법, Hanahan 방법 등이 많이 쓰입니다.
하지만 일반적으로 transformation 효율은 electroporation 방법이 훨씬 좋습니다.
 (http://bric.postech.ac.kr/myboard/list.php?Board=protocol&pkno=128)

그냥 vector를 comcell로 집어 넣을 때 electrophoration을 하고요, cloning 과정 중, ligation 후 하는게 heat shock 이더라고요... 다들 그렇게 하는 걸로 알아요. 두 transformation 방식이 다른데 두 방법은 같은 strain이라도 compcell 만드는 방법이 달라요. compcell을 어떤 방식 전용으로 만드느냐는... 님이 필요하신 만큼 만들어야겠죠.

둘에는 DNA uptake의 효율성 차이밖에는 없습니다.

electroporation으로 잘 안되면 heat shock 방식으로도 잘 안 되어야 정상입니다.

사족으로 "competent"라는 말은 외부의 DNA를 uptake할 수 있는 능력을 의미하므로

electroporation시에는 competent cell을 준비한다는 식의 표현이 부적절하다고 봅니다.

electroporation은 전기 충격으로 '순간적으로 competent하도록' 만드는 것이기 때문이죠.