제 샘플의 밴드는 two band인데요 control과 처치후 의 비교에서 약 처치후의 밴드가 줄어들기를 원하는 실험입니다...
그런데 밴드를 읽을때 develop 시간을 짧게하면 control band만 뜨고 처치 후밴드가 안떠서 density를 읽을 수 없습니다...한편 develop 시간을 길게하면 처치후의 밴드도 희미하게 잡혀 어느정도 읽을 수있습니다..그러나 control band가 진하게 잡혀 two band가 하나로 뭉쳐 보입니다...그리고 각각의 control 대비 ratio도 다릅니다...
이럴때는 처치후 밴드가 보이지는 않지만 control의 Two band가 확연히 보이는 develp time으로 실험을 해야하는지요? 아니면 처치후의 밴드도 희미하게 잡혀 어느정도 읽을 수있는 시간으로 정해야 하는 지요?
Control과 보시고자 하는 sample의 농도가 동일하다면 문제가 없을 것 같은데요. Control의 two band가 하나로 뭉쳐보이는 것을 방지하시려면, control의 size에 따라 좀 더 낮은 %의 gel을 사용하시거나 전기영동 시간을 늘리셔서 band의 간격을 더 벌리시면 될 듯 합니다. Exposure 시간을 조절하시는 것도 band의 진하기를 조절하실 수 있구요.