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 전체 > Molecular Biology-RNA > mRNA Analysis
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질문 zebrafish primer를 다른 종에도 적용할수 있나요?ㅜㅜ
알수산  | 2014.09.22 16:55
저는 zebrafish가 아닌 다른 어종으로 독성 실험을 하였는데 논문을 찾아보니 zebrafish에서 mRNA 발현량 측정에사용한 primer가 있어서 그 서열대로 주문하여 PCR을 실시 하려하는데 혹시 가능할까요?ㅜㅜ

처음 primer를 짰을때는 zebrafish와 초파리 등 몇가지 생물에서 상동성이 있는 부분의 서열을 찾아 그 서열로 primer를 만들었는데 dimer가 형성되기도 하고 product size도 제멋대로 나와서 멘붕인 상태입니다..ㅜㅜ 
#primer
 
#zebrafish
 
#mRNA
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대학원생  |  2014.09.22    
우선 zebrafish의 분류학적 위치를 알아야합니다.
같은 속, 과, 목에 해당하는 다른 어류에서 님이 분석하려는 mRNA 유전자를 검색해야합니다.
그리고 alignment를 한 다음 중복되는 영역 primer를 디자인하세요.
아니면 몇 군데 틀리면 degenerate primer를 디자인하세요.
그럼, PCR하는데 큰 문제가 없을 거예요. 화이팅!
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