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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
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질문 real time PCR과 DNA 농도 관계.. 도와주세요
qPCR초보  | 2015.02.12 11:54
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
첨부파일 파일첨부: 150211 30 cycle -.png (10 KB)
이미지 첨부파일

현재 gDNA 가지고 qPCR을 하고 있는 중입니다
standard를 잡으려고 농도를 200, 100, 50, 25, 10 으로 물로 희석하여 실험하고 있는데요
소의 dna이고 조직에서 추출하였고 순도는 1.8입니다
product size는 667 이고요
문제는 200이랑 100농도에서 증폭이 안된다는 겁니다.. 100은 그나마 ct값이 19는 되는데
200농도는 아예 증폭이 안되거나 ct 값이 2~3정도 처음부터 올라가거나 계속 이런식으로 결과가 나옵니다 ㅠㅠ
size문제라고 생각해서 500넘는것도 해보았지만 그것은 잘 나왔습니다
시약도 바꿔보고 primer도 다시 희석해봣지만 ..
다른 size 작은 것들은 200농도에서도 잘만 증폭됩니다 ㅠㅠ
아무리 찾아보고 고민해봐도 해답을 찾기가 힘드네요
결과 사진을 첨부하겠습니다 증폭된것은 100,50,25,10이고 밑에 증폭안된게 200입니다.
혹시 조금이라도 아시는분 조언 부탁드립니다 !!,ㅠㅠ

#qPCR
 
#realtimePCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리미완의꿈  |  2015.02.12   
gDNA는 real-time 하기가 상당히 까다롭습니다. 같은 gDNA를 사용해도
매번 결과값이 다르게 나오기도 하구요.
저도 상당히 애를 먹은 기억이 나네요.
농도별로 한다고해서 log값이 비례해서 나오지를 않더라구요
plasmid는 농도별로 아주 잘나오는반면에요..
결국 Taq man probe를 구매해서 해결 하긴했는데....


그런데 real-time PCR product가 667 이나 되네요
저는 real-time 용도로는 100~150bp 정도의 size의 product가 나오게 하거든요

primer도 새로 짜보세요 cDNA 합성한것도 real-time PCR 안되는것이 있어서
새로짜서 해보면 되는경우도 종종 있습니다.
qPCR초보  |  2015.02.12    
그렇군요 원래 gDNA가 까다로웟군여..ㅠㅠ
안그래도 size가 좀 커서 다시 design 했는데 특이적으로 안되서
그냥저거로 하고있는거거든요,...
저도 다시 설계하는게 나을것같아요 ㅠ
답변 감사합니다 ~!!
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