Nanodrop이 calibration이 잘 되어 있는지 확인해 보세요.
이미 농도를 정확히 알고 있는 DNA가 있다면 (상업적으로 판매하는 DNA)
그것을 control로 하여 serial dilution을 하면서 농도를 측정해 보세요.
생각할 수 있는 부분은 크게 2가지 정도 됩니다.
하나는 Nanodrop이 정확한 농도를 못 측정하는 경우이고,
다른 한 가지는 qPCR에 사용하는 primer의 증폭 효율이 안 좋을 경우입니다.
Nanodrop이 잘 안 맞는 경우가 많습니다.
다른 기기가 있다면 병행해서 DNA 농도를 재 보세요.
그리고 qPCR에 사용하는 primer를 다른 set으로 바꿔서도 시도해 보세요.