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실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > Library
Dna fragment 만들때 질문입니다.
레벨1 Microbiologycal (과기인)
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답변 1
제한효소로 처리하는것은 제한효소가 Random 하게 DNA 를 자르는것이 아니라, 특정한 Sequence 를 인지 하기 때문에 그에따른 Bias 가 생길 수 밖에 없습니다.
하지만 상대적으로 저렴하게 처리 할 수 있습니다.
반면 물리적처리인 Sonication 의 경우는 Random 하게 DNA 서열을 자르므로 제한효소를 쓰는 방법보다 더 bias 없이 Random 하게 자를 수 있습니다.
다만 Fragment 를 더 짧게 만들고자 할 수록 매우 비싼 고가의 Sonicator 가 필요합니다.
End 의 경우에는, 제한효소는 Blunt-end, Sticky-end 를 만드는 녀석이 다 있지만
Sonication 의 경우에는 End 가 일정한 형태로 생성되지 않으므로 End-repair 과정을 필요로 합니다.
아래 참고하시길..
https://www.news-medical.net/whitepaper/20141204/Isolation-of-High-Quality-Chromatin-Using-Chromatrapc2ae-Enzymatic-Shearing-Kit.aspx
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