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질문 GraphPad Prism 5 IC50 계산 문의드립니다.
올챙이대학원생파이팅(대학원생)  | 2019.08.26 15:05
첨부파일 파일첨부: 이게 맞는건가.xlsx (10 KB)

MTT Assay를 통하여 2가지의 약물을 2.5 uM에서 40uM까지 얻은 결과값을 이용하여 IC50값을 구하곤 했는데요.

 

최근 제가 구하고 있는 방법이 무언가 잘못되었다는 느낌이 생겨서 질문을 드리고 싶습니다.

upload_image

MTT Assay 결과를 토대로 그린 IC50 그래프값입니다.

sample 1의 경우 IC50 7.3 이며 sample 2 의 경우 IC50의 값이 8.3입니다.

그러나 MTT 데이터를 살펴보면 sample 2 IC50 가 8.3으로 나오는 것과는 그 결과가 너무 달라 보여서 질문 드리고싶습니다.

제가 지금 하고있는 데이터 분석이 맞는것인지.. 다르다면 어떻게 바꾸어야 하는지 알고싶습니다.

 

IC50값을 구할 때, 프리즘에서 XY 그래프 선택란에서 그래프를 선택하고

MTT 값을 기입한 뒤 트랜스폼을 이용하여 X=log[X]로 바꾸어주 고

Normalize한 뒤 Nonlinear regression ( curve fit.) 에서

Dose-response Inhibition

Log(Inhibition) vs Normalized response Varable slope를 선택하여 데이터를 분석합니다.

 

분석하는 데이터 파일도 첨부해보았습니다. 아시는 분께 부탁드리겠습니다

재분석을 부탁드리는 것이 아닙니다. 제 분석방법이 맞는것인지, 아니라면 어느 부분이 잘못되었는지 알고 싶습니다.

#IC50
 
#Prism
 
#Graphpad
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
황인선  |  2021.03.30    
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

Log(Inhibition) vs Normalized response Varable slope를 선택하여 데이터를 분석합니다.
 

이 부분에서 잘못된것같습니다 저도 이걸알아보고있는데 어렵군용

황인선  |  2021.03.31    
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

Log(Inhibition) vs Normalized response Varable slope를 선택하면 해당 데이터를 그래프방정식으로 하여 Y값을 0-100까지로 설정합니다.

 

Log(Inhibition) vs response variable slope (four 파라미터)를 기본적으로 사용하는 것 같은데 이 방정식을 사용할 때도 cell viability가 거의 4-100까지는 나와야 합니다. 

 

한 cell viability 가 거의 40-100 % 된다면 두번째 방정식을 사용해도 ic50의 제 값이 나오지 않는 것을 확인하였습니다.

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