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질문 dna sample 제작에 관련하여 질문이 있습니다.
올챙이ryul7957(일반인)  | 2020.12.12 15:27

안녕하세요 실험에 관심이 많은 고등학생입니다.

 

최근 동아리에서 브로콜리 추출 실험을 하였는데요.

방법은 브로콜리를 막자사발로 갈고 Lysis와 반응 시킨뒤 에탄올과 만나게 하여 dna를 얻었습니다.

추가실험으로 이 dna를 전기영동하려 하려고 합니다.

그러려면 위의 dna를 스핀다운하고 에탄올과  분리시키고 멸균수로 녹여 사용 하는것으로 알고 있습니다.

여기서 질문이 두가지 생기는 데요 

1.위 과정~전기영동 과정까지 spin column을 사용해도 되나요?(여과목적으로)

2. 위 과정으로 전기영동을 할 수 있을 까요? (겔로딩이랑 프리메이드 아가로스겔은 구입하였지만 제한효소는 구입하지 못했습니다.)

#dna
 
#전기영동
 
#spin column
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
올챙이Sangyoon  |  2020.12.12   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.
우선 실험의 목적이 DNA 추출 시험이라면 굳이 전기영동을 할 필요가 있는지요? DNA인 걸 확인하기 것이 목적인지요? 대학연구실이나 기업 실험실 가서 nanodrop같은 측정기이나 고등학교 실험실에 스펙트로미터 있으면 DNA양을 정량할 수 있답니다. 전기영동은 DNA를 제한효소로 처리하지 않은 상태에서도 충분히 할 수가 있답니다. 전기영동할 때 DNA ladder 가지고 loading해서 추출된 DNA양 정량도 할 수도 있고요. 다른 실험 기구나 장비 필요하면 도와드릴 수도 있으니 알려 주세요.

그리고 dna는 에탄올에 녹지 않고 물에는 녹습니다.

그리고 spin column이 있으면 어떤 kit를 사용하셨는지요? 아니면 spin column만 있고 lsysis buffer, elution buffer wash buffer 등은 본인이 만들어서 사용했다는 건지. 추출 방법이 그냥 집에서 쓰는 일반 제품만 가지고 DNA 육안으로 확인하는 방법으로 하는 건지 잘 모르겠네요. 제한효소 샘플은 무료로 보내주는 회사들 많습니다. 본인이 직접 신청해도 되는데 아마 end user를 학교로 등록하시는 것이 좋습니다.
올챙이ryul7957  |  2020.12.13   
첨부파일 파일첨부: Screenshot_20201213-083651.png (502 KB)
이미지 첨부파일
sangyoon님 답변 감사드립니다..
우선 동아리 활동으로 브로콜리 dna추출 실험을 하고나서 이것을 확인 해볼 수는 없을 까 하는 찰라에 학교 수납장에서 전기영동장치가 2~3개 발견되어 실험을 계획하게 되었습니다. 그리고 spin column은 생물나라에 나와있는 상품을 구매하였습니다. lysis는 계면활성제 소금 정제수로 제작하였고요. elution같은 경우에는 삼차증류수로 대신 하려고 하고 있습니다. 그런데 wash buffer같은 경우에는 조성을 모르겠습니다 .
wash buffer를 학교에서 만들 수있을 까요?
또 실험에서 꼭 써야하는 건가요?
기존에 브로콜리 추출은 '계면활성제와 염화나트륨으로 제작한 용액과 혼합하여 일정시간이 지난 후 에탄올을 2배로 따라 하얀 실이 나오는 것을 확인한다'로 하였습니다.
추가로 제한효소 셈플을 받을 수 있는 대표적인 회사에는 어디가 있나요?
대왕개구리SPEED  |  2020.12.13   

gDNA는 흡광도 측정 만으로 잘 추출되었는지 분해되면서 추출되었는지

알수 없기 때문에 전기영동으로 추출 상태를 확인하는 것이 좋습니다.

spin column을 사용해서 추출할 경우의 용액을 전부 만들수 있나요?

binding buffer는 어떤 조성으로 만들었나요?

 

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