안녕하세요.
식물의 잎에서 gDNA를 추출하는 실험을 많이 합니다.
gDNA 추출시 potassium acetate를 사용하는데요,
일부 식물의 종 내에서 어떤 계통은 gDNA가 뽑히고 어떤 계통은 뽑히질 않습니다.
원인을 구체적으로 알고 싶은데 혹시 원인을 아시거나 또는 참고 할 만한 자료가 있을까요?
감사합니다.
K+문제가 아니라 모든 식물에서 cell lysis가 잘되는지 검토해 보세요.
SPEED님 안녕하세요?
20종 이상의 식물에서 문제없이 DNA를 추출하고 있습니다.
다만 한 식물(고추)에서 potassium acetate을 넣었을 때 DNA가 뽑히지 않는 샘플이 간혹 있습니다. 반복해봐도 마찬가지고요. potassium acetate를 넣지 않고 실험을 하면 DNA가 뽑힙니다.(깨끗하진 않지만요)
원인을 과학적으로 알고 싶은데 관련 키워드로 검색해도 잘 찾지 못하겠습니다ㅜㅜ
potassium ion 문제는 아닙니다.
추출 방법을 알수 없어 뭐라 단정하기 힘들지만 cell lysis 후 free DNA만
용액에 잘 노출되면 침전이 안될수 없습니다.
따라서 free DNA 상태를 잘 만들어 주지 못해서 그럴겁니다.