[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
머크
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
BioLab 박소정 교수
전체보기 안전점검 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Purification/Isolation
조회 475  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 plasmid prep 후 농도와 plasmid band 패턴이 관련이 있을까요?
알소람(대학원생)  | 07.19 09:55

안녕하세요! 이상한 plasmid로 인해 실험에 차질이 생겨 조언을 얻고자 질문 올립니다. 

plasmid prep 후에 nano drop으로 측정한 농도가 일반적인 sample의 1/10 이상 낮게 나왔습니다. (일반적으로 적어도 100ng/ul 이상은 나오는데 10ng/ul대입니다) 그래서 1% agarose gel에 plasmid를 걸어보니 supercoil form과 linear form으로 추측되는 band, 이 2개 band가 거의 비슷한 진하기로 나오더라구요. 제한효소 처리하였을 때는 깔끔하게 잘 잘리구요!

제한효소 처리해서 괜찮으면 어떤 form이든 plasmid를 사용하는 데 있어서 문제가 되진 않는다는 의견을 봤는데요, 제 경우에는 plasmid 농도가 너무 낮게 나와서 실험에 이용하기가 힘듭니다ㅠㅠ 

다른 sample과 함께 prep을 진행하였는데 항상 이 sample 하나만 이러한 결과가 나오는 걸로 봐서는 prep 과정의 문제는 아닌 것 같습니다.

그리고 이 sample도 수율이 높았던 적이 있었는데 그 때의 plasmid를 gel에 걸어보니 지금 수율이 낮게 나오는 것과 전혀 band 패턴이 다르더라구요. supercoil form이 가장 많은 일반적인 plasmid band 패턴이었습니다!

수율이 낮은 것과 plasmid band 패턴이 이상한 것이 관련이 있을까요?

아무리 서치해봐도 속시원한 답이 나오지 않네요,, 혹시 이런 경우가 있었던 분이 계시다면 조언 부탁드립니다..!

#plasmid prep
 
#agarose gel electrophoresis
 
#plasmid band
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  07.19 10:03  

- 농도와 패턴은 상관 관계가 크게 없습니다.

 

- 농도 : 추출 수율과 관련

 

- 패턴 : 추출 과정이 smooth 또는 rough한지에 관련

답변하기
할인행사/신제품신기술 광고 검색광고
바이오닉스 바이오닉스
[TECAN No.1 한국공식대리점] TECAN Automation / Liquid handler / Mic.. (12.31까지)
정코퍼레이션 정코퍼레이션
Cryogenic Label Printing System (5.31까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
스트레스없이 3D 세포를 배양해보세요!!
마크로텍 마크로텍
마크로텍 현미경 보유분 연말 특가판매~!! (12.30까지)
바이오클론 바이오클론
[Bioss] 겨울 맞이 행사 (12.30까지)
바이오클론 바이오클론
Biolegend 한국대리점 Biolegend 30% 할인행사 (12.30까지)
최근등록   더보기 >
배양액을 냉장보관해도 되나요?   12.06
Elisa blank 설정   12.06
L6 계대 관련 질문입니다ㅠㅠ   12.06
L6 계대 관련 질문입니다ㅠㅠ   12.06
Working volume   12.06
SDS-PAGE gel running buffer재사용   12.06
잘 뭉치는 cell culture 법   12.06
western blot 샘플을 ELISA에 사용 가능할까요?   12.06
Kaplan meier 분석에서 두 그룹간 비교하여 그래프 그릴 때 정의역 문제   12.06
DNeasy Plant Mini kit 관련   12.06
최근답변자 우수답변자
개구리AstV

올챙이쥐팤

알잘뽑고싶어요

개구리오이가싫어

올챙이CBD 김선..

대왕개구리SPEED

개구리Marine

올챙이텔루르

꽃개구리bio

개구리식스센스

개구리G.P.Ts

개구리Q.E.D.

개구리곰돌2

개구리ExDown's

개구리안녕난세포야

대왕개구리엘피스

실험관련연재
세오 연재중실전 실험 프로토콜 101
세오 (필명) (Cincinnati Children’s Hospital Medical Center)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
박은총 연재마감후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
Mr.S 연재마감의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재마감실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
이제욱 연재마감생명과학자 기초체력 다지기
이제욱 (오송첨단의료산업진흥재단, 신약개발지원센터)
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아 광고