[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
써모피셔사이언티픽
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
전체보기 안전점검 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 476  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 Oligomer sequence 길이
알초초초초초보(과기인)  | 08.30 16:03

안녕하세요

실험 새내기 입니다.

서치를 해보다가 잘 모르겠어서 여기에 도움을 요청드립니다.

Oligomer 를 Probe, Primer 와 함께 제작해서 Probe test 를 해보려고 하는데요. 

Probe 이나 Primer 는 제작하는 조건, 기준 다 나와있는데 Oligomer 는 그런 기준이 안나와 있어서요..

Mutation 이 포함된 Oligomer 를 제작할때 길이를 얼만큼 하나요..?

해당 변이 앞 뒤로 얼만큼 끊으면 되는건가요??

혹시 고려해야하는 조건들도 있을까요?

 도움주시면 감사하겠습니다 ㅠㅠ..

#oligomer
 
#sequence
 
#길이
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
-_-  |  08.30 19:45   

뭐에 쓰는 프로브 프라이머 올리고머인지 알아야 뭐라도 답글이 달리지 않을까요?

예를 들어 올리고머란 말은 단순히 그냥 중합체란 단어인데,

이 구성 요소가 뭐냐에 따라 단백질일 수도 있고 핵산일 수도 있습니다.

단어의 개념을 정리하고 좀 더 자세히 질문글을 쓰는 게 좋겠습니다. 

대왕개구리SPEED  |  08.31 09:05  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

- mutation 용이면 mutation 길이에 따라 달라집니다.

알초초초초초보  |  08.31 14:02  

뭐에 쓰는 프로브 프라이머 올리고머인지 알아야 뭐라도 답글이 달리지 않을까요?

-> 앗 죄송합니다. Mutant detect 을 위해 ddPCR을 진행하고자 합니다.

하기전에 TP53 p.Q331fs Mutant oligomer 와 WT oligomer, 해당 Oligomer 들에 해당하는 probe과 primer 들을 제작하려고 합니다.

Probe 와 Primer 를 제작할때 MUT 및 WT Oligomer sequence가 있어야 하더라구요.  

그래서 MUT 및 WT Oligomer sequece를 짤때, 길이를 얼마나 짜야하는지, Probe 이나 Primer 짤때처럼 조건들이 있는지 궁금합니다..!

WT Oligomer 는 변이가 일어난 부분이 포함된 TP53 reference sequence로 짤 예정이고 MUT Oligomer 는 WT Oligomer 에서 변이가된 sequence로 짤 예정입니다.

그 변이부분 포함하여 앞 뒤로 어느정도 길이로 짜야하는지

앞뒤로 길이가 똑같아야 하는건지

길게 짤수록 좋은건지

해서요.. 선생님 도움주시면 감사하겠습니다.. 

 

-_-  |  08.31 17:19   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

https://www.bio-rad.com/ko-kr/life-science/learning-center/introduction-to-digital-pcr/planning-ddpcr-experiments?ID=MDV33OKG4

저도 ddPCR은 안해봤는데 바이오라드사 프로토콜엔 75~200bp짜리 template쓰는 걸 추천한다고 돼 있네요.

근데 이걸 왜 하는 거에요? 프로브를 바로 안 쓰고 굳이 테스트해야 할 이유가 있습니까?

누가 시켜서 하는 건지 아니면 본인이 생각하고 하시는 건지는 모르겠지만 이걸 위해

세포나 조직, 생물 갈아서 얻은 template가 아니라 oligomer를 굳이 따로 합성해서

테스트를 해야 할 필요가 있나 궁금하네요.

알초초초초초보  |  09.01 17:10  

근데 이걸 왜 하는 거에요? 프로브를 바로 안 쓰고 굳이 테스트해야 할 이유가 있습니까?

누가 시켜서 하는 건지 아니면 본인이 생각하고 하시는 건지는 모르겠지만 이걸 위해

세포나 조직, 생물 갈아서 얻은 template가 아니라 oligomer를 굳이 따로 합성해서

테스트를 해야 할 필요가 있나 궁금하네요.

-> 아 이렇게 하라고해서 진행을 하고있는거긴 한데요.

검체가 충분하지 않아서 Oligomer로 먼저 테스트 해서 조건을 잡으려고 합니다.

 

답변하기
할인행사/신제품신기술 광고 검색광고
정코퍼레이션 정코퍼레이션
Cryogenic Label Printing System (5.31까지)
바이오닉스 바이오닉스
[TECAN No.1 한국공식대리점] TECAN Automation / Liquid handler / Mic.. (12.31까지)
사이젠 사이젠
[Cyagen 슈퍼할인] KO마우스 무료 증정/녹아웃 카탈로그 모델 $2950 이상 할인 (12.31까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
스트레스없이 3D 세포를 배양해보세요!!
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
재현성 있는 (q)PCR을 위해 필요한 분주 자동화 기기, BMS의 Myra
마크로텍 마크로텍
마크로텍 현미경 보유분 연말 특가판매~!! (12.30까지)
최근등록   더보기 >
HPLC 액-액 추출 염석효과   12.03
셀 자라는 속도 문의드립니다..   12.03
westernblot membrane이 왜이럴까요? ㅠㅠㅠㅠ제발도와주세여....   12.03
PCR 초보 질문입니다ㅠㅠ   12.03
adenovirus-36의 감염 기전, 동향 등에 관해서   12.03
pcr 밴드보는법?   12.02
농도 계산 방법 (ppm , 몰비)   12.02
colony PCR 결과가 궁금합니다   12.02
골격근 단면적 CSA measure   12.02
PANC-1, MIA paca-2 차이점   12.02
최근답변자 우수답변자
알짱이되고싶어여

올챙이꿈많은청년

대왕개구리SPEED

알duqdlghksd..

알합성인데 생물공부

올챙이으리으링

뒷다리구릅

꽃개구리착한사람

꽃개구리발그런

개구리처음처럼

개구리Marine

개구리절대교주

개구리곰돌2

꽃개구리착한사람

꽃개구리발그런

개구리secu

실험관련연재
세오 연재중실전 실험 프로토콜 101
세오 (필명) (Cincinnati Children’s Hospital Medical Center)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
박은총 연재마감후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
Mr.S 연재마감의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재마감실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
이제욱 연재마감생명과학자 기초체력 다지기
이제욱 (오송첨단의료산업진흥재단, 신약개발지원센터)
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아 광고