실험 Q&A Mol. Biol.-RNA > etc.
전사체분석 유전자선발 관련 질문입니다
레벨1 윤주쓰 (대학원생)
저는 DEG를 탐색하여 log2fold change를 통해 걸러내고, 그 후 여러과정을 통해 후보유전자를 걸러내고있습니다.
이제 거의 최종적으로 FPKM을 보고 발현값이 낮은 값을 걸러내려고 하는데, 사진과같이 W30~M100까지 6가지의 항목전체가의 FPKM이 10이하일 경우 제거를할려고 합니다.
그렇게되면 사진과 같이 주황색으로 표시한것이 남게되는데,
이렇게 발현값이 낮은것을 주관적으로 걸러도 되는건지가 의문이 들어서 질문남깁니다. 논문쓰기에는 이전 선발 기준에 비해 뭔가 unscientific한 느낌이 들어서요ㅠㅠㅠ
답변주시면 감사하겠습니다!!
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