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질문 low copy plasmid prep
개구리clickclick(과기인)  | 2022.10.11 16:58

아래 질문을 하고 low copy일 수도 있다고 했는데, 

Plasmid를 midi prep (preparation)을 하게 되면 일반 vector의 경우 400-600 ug/mL 농도가 나와서  Cell Transfection 할 때에 잘 사용하고 있어요. 

그런데 사이즈가 큰 lentiviral vector (0.8~12kb)가 들어간 E.coli에서 plasmid를 prep 할 때에, 
Elution 용액을 70도로 데워서 elution을 해도 30~100 ug/mL 농도가 나와요.

가~~~~끔 농도가 높게 나오기도 하는데, 이게 case by case 같이 유독 그 vector가 농도가 들쭉날쭉해서, 

혹시 lentiviral vector plasmid prep 할 떄에 주의사항이나, 방법적으로 알고 있어야 하는 것이 있는지 궁금합니다. 

판매사에서는 high copy라고 하지만, 해당 브랜드에서 구매한 것이 

대다수 뽑힐 때에 문제가 있는 것으로 보아, 

copy수가 높지 않다고 가정하고, 

혹시 plasmid가 low copy일 때는 plasmid prep 과정에서 

high copy보다 키우는 양을 대략 몇 배 준비해야 할까요?

 

보통 midi prep 에서는 전날 50 mL media 에 seed culture 해서 

37 도에서 over night으로 키웠어요. 양을 4~5배 늘리면 될까요? 

 

#low copy
 
#plasmid prep
 
#plasmid dna
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
-_-  |  2022.10.11    
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

미디/맥시프렙 할 때 보통은 다 키트 쓸 테니 키트 매뉴얼에 맞춰서 준비하시면 됩니다.

123  |  2022.10.11    
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

cell 양을 줄이거나 reagent 양을 늘려보세요

너무 많은 cell에 의해 reagent가 제 역할을 하지 못하기도 합니다.

특히 lysis가 제대로 되지 않으면 적은 농도의 plasmid를 얻을 수밖에 없습니다.

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