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BioLab 김한준 교수
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 전체 > Molecular Biology-DNA > Transformation
조회 982  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 Transformation 계산 방법이 잘 이해가 안됩니다.
알dndb1303(대학생)  | 2022.11.18 06:32

안녕하세요.

Bacterial transformation 실험에 주력하고 있는 학부생연구원입니다.

Transformation efficiency를 다른 논문에서 참고해서 계산을 하려고 하다보니, 대부분의 논문이 CFU/ug를 단위로 쓰더라고요. 이 단위의 뜻이 주어진 양의 competent cell에 DNA 1ug을 transformation 했을 때 생성되는 colony의 수라고 하는데,

다른 분의 의견으로는 Transformation efficiency면 사용된 competent cell의 전체 수에서 transformation된 세포의 수를 말하는 것이니까 transformation 후 spreading할 때 한 샘플을 selective plate와 항생제 없는 배지에 따로 키워서 항생제가 있는 배지에서 자란 콜로니 수를 항생제 없는 배지에서 자란 콜로니 수로 나눠야하는 것 아니냐는데, 그 말도 맞는 것 같아서요. 사실 transformatinon efficiency 정의를 봤을 때 잘 이해가 안되기도 하고요.

혹시 이것과 관련해서 이 공식이 어떻게 transformation efficiency를 설명하는 것인지.. 왜 CFU/ug을 unit으로 쓰는지 알려주실 분 계실까요?ㅜㅜ
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#transformation efficiecny
 
#Bacteria
 
#transformation
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2022.11.18   

- 사용된 competent cell의 전체 수에서 transformation된 세포의 수를 말하는 것이니까

: CP cell 수는 고정되어 있고 사용한 plasmid 양에 따라 TF된 cell 수가 달라지기 때문에 TF 효율로 사용하기에는 힘듭니다.

 

- 예로 동일 CP cell에 각각 0.1ug, 0.01ug의 plasmid를 TF했을 경우 colony가 10배 차이가 나기 때문에 이 숫자로 TF 효율이 10배 차이가 난다고 할수 없습니다.

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