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BioLab 김한준 교수
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 전체 > Molecular Biology-DNA > Transformation
조회 1758  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 Transformation 효율이 너무 안좋습니다.. 저와 비슷한 경험 하신분 있으신가요??ㅠㅠ
알또찌까까(대학원생)  | 2022.11.29 10:00

안녕하세요 현재 대학원 석사 1년차입니다.

원래 게속해서 진행해온 cloning과 transformation이 8월달 부터 인가 뭔가 점점 이상해졌습니다. 저희가 기존에 만든 C-cell을 이용해서 계속해서 transformation을 진행했는데요, 8월달 부터 transformation을 한 이후에 mini-prep을 진행해온 결과 원래는 300-400ng으로 잘 나왔었는데 어느순간 갑자기 50ng으로 확 효율이 떨어졌습니다.(mini prep kit 사용했습니다.) 너무 이상해서 여러번 transformation도 해보고 배지도 다 바꾸고 새로 다 만들어서 했는데도 이상해서 C-cell이 문제겠거니 해서 다른 랩에서 얻어온 C-cell을 이용해서 transformation을 해본 결과 비슷하게 나왔습니다.

그래서 C-cell을 사서 새로 transformation을 했는데 다행히 colony가 잘 떠서 liquid culture을 진행했는데요, 아니나 다를까 또 mini-prep을 진행한 결과 50ng밖에 안나왔습니다...ㅠ 심지어 안자란것도 있습니다..ㅜ

antibiotic marker는 ampicilin을 이용하였구요.. 새로 산 DNA가지고도 transformation을 했는데 하나도 자라질 않았네요.. 일단 저희 학교 내 실험실에서 해볼 수 있는 모든 경우의수를 다 해보았는데 도저히 돌파구가 보이지 않네요... 혹시 저와 같은 비슷한 경험을 해보신 분이나 problem solving하신 분들 있으신가요??ㅠㅠ 

#transformation
 
#mini prep
 
#competent cell
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2022.11.29   

- TF 효율 문제가아니라 prep.문제로 보입니다.

 

- CP cell 종류가 어떻게 되나요?

 

- empty vector를 추출해도 수율이 낮게 나오나요?

알또찌까까  |  2022.11.29   

CP cell 종류는 DH5알파 이용하였구요,

empty vector transformation 했었을때도 동일하게 나옵니다ㅠㅠ

miniprep kit 같은 경우에는 저희 실험실에서 예전부터 아무 문제없이 계속 사용했었던거라 아무 의심없이 사용했었습니다ㅠㅠ

저희 실험실에서 저만 이런게 아니라 다른 인원들도 동일하게 나와서 계속해서 뭔가 이상한게 느껴집니다ㅠㅠ

대왕개구리SPEED  |  2022.11.29   

- 다른 Lab의 prep. kit를 빌려서 한번 해보세요.

개구리아이이이잉  |  2022.11.29   
heatshock 온도도 다시 체크해보세요
지나가는 사람  |  2022.11.29    

날이 추워지면서 랩의 온도가 낮아지면 lysis 버퍼가 결정이 생기는데.. 그걸 그대로 사용한건 아닌지요...

프렙 하시기전에 솔루션들이 모두 잘 용해 되어 있는지 확인해 보시는걸 추천드려요.

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