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질문 Kaplan meier 분석에서 두 그룹간 비교하여 그래프 그릴 때 정의역 문제
알mulgrew(대학원생)  | 2022.12.06 14:01

안녕하세요 선배님들,

제가 gene A의 발현량을 기준으로 gene A가 낮을 때, gene B의 high, low group의 survival을 비교하려 합니다. 

RNA seq data를 전처리하여 kaplen meier를 그리려 하는데, gene A를 기준으로 나눈 gene B high 그룹과 gene B low 그룹의 정의역(overall survival(months))가 서로 달라 한 그래프에 나타낼 수 없는 어려움을 겪고 있습니다. 이러한 문제를 겪거나 해결하신 선생님들의 도움을 얻고자 이렇게 질문드립니다. 사용하고 있는 툴은 matplotlib입니다. 감사합니다. 좋은 하루 되세요 

#matplotlib
 
#kaplen-meier
 
#survival
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리AstV  |  2022.12.07   
카플란 마이어 추정 그래프를 개인적으로 그려본 적은 없지만, 시간 흐름에 따른 어떠한 사건의 발생확률을 나타내는 그래프를 그리시는 것 같고, 아마도 개월이 지나갈수록 환자?의 생존 확률을 그리시는 것으로... 예상해보는데요.

X축 month가 gene B high와 low간에 상이하다면, matplotlib의 subplot 기능을 사용하셔서 두 개의 그래프로 나눠 그리시는게 가장 이쁠 것 같습니다.

만약 확률의 범위가 달랐다면 matplotlib의 twinx로 y axis를 하나 더 추가하면 되겠지만, x axis 범위가 다르면.. subplot이 좋은 방안인 것 같네요.
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