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 전체 > Immunology > Immunoprecipitation
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질문 ChIP PCR 질문
올챙이TMV세균맨(과기인)  | 2022.12.09 10:59

ChIP qPCR을 이제 막 공부하는 중입니다.

제 질문은 ChIP PCR을 하는 이유가 무엇인지 궁금합니다.

 

제가 보는 논문에서 ChIP qPCR은 DNA에 Binding 하는 Protein(Histone이나 Transcription Factor 등)을 Immunoprecipitation으로 제거하고 DNA만을 회수하여 qPCR을 합니다.

 

여기서 궁금한 점은

이미 Protein이 Binding 하는 서열을 알고 있다면 굳이 qPCR로 정량을 할 필요가 있는가? 입니다.

PCR로도 어느 정도 대강 정량이 가능할테고, 그 외에 다른 방법으로도 얼마든지 정량을 할 수 있을텐데 굳이 왜 ChIP을 하는지요?

 

만약 Protein이 Binding 하는 서열을 모른다면 Primer는 어떻게 짤 것인지, Specific 하게 PCR 되는지 어떻게 알 것인지요?

 

 

#ChIP
 
#Immnoprecipitation
 
#PCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리BlackSmile  |  2022.12.09   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

일반적으로 ChIP qPCR은 "내가 보고 싶은 target DNA가 얼마나 Protein에 binding하고 있는가?"를 확인할 때 실험을 합니다.

 

Transcription factor와 target gene의 binding을 예로 들자면,

약물을 처리하였을 때 target gene에 binding하는 transcription factor의 양이 늘었는지 줄었는지를 확인하기 위해 ChIP 후 qPCR을 합니다.

Protein이 binding하는 DNA를 모를 경우, ChIP-seq을 진행하여 binding하는 전체 DNA의 sequence를 읽어버릴 수 있습니다.

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