실험 Q&A Mol. Biol.-Protein > etc.
mascot damon과 maxquant에서 동시에 여러 treatment 비교
레벨1 qwerty7710 (대학생)
안녕하세요 농화학과에서 공부중인 학부연구생입니다.
comparison은 2개 genotype, 2개 stress level, inoculation 유무로 2*2*2해서 총 8개 treatment로 벼작물로 protemics 공부하는중입니다
mascot에서 나온 empai로 엑셀에서 두개 트리트먼트씩 해서 fold change를 구하고 각 comparison끼리 비교를 해서 모든경우의 수를 공부해봤는데
같은 처리구로 mRNA seq를 공부하다보니 CLC work bench에서는 동시에 모든 treatment를 GUI에 넣고 control로 inoculation group, stress level을 따로 설정해서 돌릴 수 있더군요..
clc에서 한거처럼 proteomics에서도 모든 treatment를 동시에 넣어서 분석해보고싶은데 mascot이나 maxquant나 preseus같은 프로그램에서 이 같은 분석이 가능할까요??
아시는분 있으면 부탁드리겠습니다ㅜㅜ 감사합니다!
qwerty7710@naver.com
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