실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
qRT-PCR , triplicate(replicate)에 대해서
레벨1 대학원지망생 (대학생)
안녕하세요. qRT-PCR를 공부하다 의문점이 생겨 질문드립니다. 그림을 보면서 질문 드리는게 빨라 그림을 먼저 제시합니다. (5개의 샘플, 6개의 유전자(5개유전자 +GAPDH))
이 논문에서는 WT(정상인)과 환자4분(FD-1,FD-2,FD-3,FD-4)으로 부터 유래한 세포를 배양하여 qRT-PCR를 진행한 디자인 입니다.
이 논문에서는 qRT-PCR는 triplicate으로 진행했다고 하였으며 SEM(N=3)을 했다고 나와 있습니다.
1. 제가 이해하기로는 1,2,3번 컬럼의 WT이 모두 하나의 세포 배양plate에서 추출한 RNA로 이해했는데 맞나요? 즉 qRT-PCR당 5개의 세포배양을 준비해야하 하고 N=3이니 총 15개의 세포배양을 해야한다 라고 이해했는데 맞나 모르겠습니다.
1번의 경우 (The data are expressed as means +- SEM(n=3).)
2. 사실 위의 개념이 햇갈린 이유는, 다른 논문에서는 triplicate로 qRT-PCR로 진행했다고 하면서 mean+sd 의 그래프를 제시합니다. 이 경우는 1,2,3번 컬럼에서 WT이긴 하지만 하나의 세포배양 plate가 아닌 3개의 서로 다른 plate로 한번에 qRT-PCR진행한것 같습니다 맞나요?
2번의 경우 (Experiments were conducted in triplicate (mean ± SD).)
3. 제가 위에 제시한 개념이 모두 맞다면 1번과 2번 경우 모두 기술적 차이는 없는것 인가요? 2번의 방법으로 제시해도 괜찮은지 그 qPCR 오차에서.. 그런부분이 좀 신경쓰입니다. 물론 실험디자인상 실험가격도 고려해야할 중요한 요소 이지만요
감사합니다.
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