실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
Primer design 과정에서의 문제점
레벨1 willi1234 (대학원생)
안녕하세요.
qRT-PCR을 준비하고 있는 대학원생입니다.
Thermo fisher 사의 OligoPerfect을 이용하여 관찰하고자 하는 gene의 primer를 디자인하고 있습니다.
NCBI의 Blast를 통해 primer가 제대로 디자인 되었는지 확인작업을 하는 중인데, 간혹 보고자 하는 gene의 이름이 아닌, 염색체 자체가 뜨는 경우가 종종 발생합니다.
예를 들어, F11R이라는 gene symbol의 유전자를 관찰하려는 경우, NCBI Blast를 돌렸을 때, Huxu chromosome 25 이런식으로 뜨는 경우가 있습니다.
OligoPerfect 말고 다른 프로그램을 이용하여 primer를 디자인해야되는건지 싶기도 하네요..
이럴 때, 염색체가 아닌 제가 보고자 하는 gene만 확인하고자 하는 경우, 어떻게 하는 것이 좋을지 고견 부탁드리겠습니다..
읽어주셔서 감사합니다.
Bio마켓 프리미엄