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 전체 > Molecular Biology-DNA > Gene Cloning
조회 1619  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 double digestion후gel run
개구리BBluee(일반인)  | 03.20 14:27

upload_image

cloning하는 중에 콜로니 dna prep후 enzyme double digestion해서 

gel run했는데 위에 밴드는 무엇일까요? uncut?

2개 엔자임중에 한개가 아무래도 유효기간이 오래 된 것이라 working안한건지

.....아래밴드는 5kb정도에서 보이긴 하는데 이 gel 사진만으로 콜로니들이  pseudo colony라고 판단할 수 있나요?

#cloning
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  03.20 14:40  
1.안자른 band는 없나요?

2.DNA양을 줄이고 천천히 전기영동하세요.

3.자른 시료를 전기영동 할때는 vector만 자른것도 전기영동하세요.
개구리BBluee  |  03.20 15:02  

upload_image

dna prep후 1ul  loading한 거예요.

upload_image

이것은 double digetion 한거구요.

upload_image

벡터 잘라서 1ul run한 것

젤런을 천천히 해야하는 특별한 이유라도 있을지요?

dna양이 너무 많아서 안잘린 것인지 , pseudo colony라서 그런건지...

 

 

 

대왕개구리SPEED  |  03.20 15:48  

- 전기영동 상태가 상당히 안좋으며 끌려서 내려오는 현상은 우선 천천히 내리는 것이 좋습니다.

 

- 전기영동 사진은 임의로 자르지 말고 gel 전체를 제시하는 것이 좋습니다.

 

- 전기영동 거리는 항상 일정하게 하는 것이  좋습니다.

 

- 어떤 marker를 사용하고 gel은 몇%인가요?

 

- vector 자른거, clone 안자른거, clone 자른거는 같은 gel에서 비교하는 것이 분석하기 용이합니다.

 

- 현재로서는 vector 1cut, clone 1cut을 해서 분자량 비교를 해 보는 것이 좋을 듯 합니다.

개구리실험조아  |  03.21 14:40  

size marker 상단이 10kb일거라 생각되는데 위쪽에 나타난 smear된  band형태의 정체를 알 수 없네요.

 

7개 lane이 동일한 실험에서 얻은 colony를 길러 plasmid prep한 거라면 서로 사이즈가 상이한것으로 보아 사이즈 큰것 (3, 4, 7)이 insert 되었을 수도 있습니다. 이 경우 one cut 되었거나 enzyme digestion이 전혀 안된것 같습니다.

 

enzyme digestion할 때 사용하는 plasmide DNA의 양을 줄여야할 것 같아요.

 

agarose gel 도 잘 굳힌 후 loading한 건지도 확인하시구요.

 

 

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