Oligonucleotide의 MALDI TOF MS 분석과 관련하여 문헌조사를 하는 중입니다.Oligonucleotide 합성도 처음이고 MALDI도 처음이라 좀 시행착오중이긴한데

그 과정에서 궁금한게 생겨 질문 글 올려봅니다.

아래와같이 올리고의 합성에 따른 과정을 MALDI TOF로 찍어봤을 때

Detritylation에 따라 5'의 보호기인 DMT가 떨어지는건 알겠는데,

1. 그렇다면 Mass를 나타낸 우측 결과에서는 d1 부분에대해서만 -DMTr을 해주면 될텐데 왜 d2,d3도 모두 -DMTr을 해줘서 질량값을 나타내나요???

2. Main Peak 외에 Small Peak의 질량에 대해서는 그냥 부산물이겠거니 하고 무시해도 되는 건가요?

(예를들면, Coupling 하고 나서의 Mass Peak을 보면 1226.6 옆에 1242.4, 1264.8 등의 마이너한 Peak들)

답변부탁드립니다!!!!

(참조 논문: NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS, 20(4–7), 951–954 (2001))