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 전체 > Molecular Biology-DNA > Gene Cloning
조회 10181  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 t-vector cloning
cloning  | 2009.04.28 14:58
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
첨부파일 파일첨부: p-GEM.pdf (359 KB)

cloning을 수없이 해야하는 관계로 commercial한 T-vector를 무한정 쓸 수 없어서,
T-vector를 cloning해서 쓰고 싶은데요.
찾아봤더니 enzyme처리와 primer를 다시 짜야 한다고 나오더라구요.

1. enzyme : 어떻게 선택해야하는지..
2. primer design : 선택한 enzyme만 포함시키면 되는건지요...

참고로, 제가 쓰고있는 t-vector map 올립니다.

조언부탁드립니다...

#t-vector
 
#cloning
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2009.04.28   
T vector를 만들어 사용하는 방법을 원하십니까 ?
대왕개구리엘피스  |  2009.04.29   

갖고 계신 TA vector를 이용한 실험에서 Blue colony중 한두개를 얻어 Plasmid를 뽑은 후 EcoRV를 사용하여 잘리는지를 먼저 확인해 보세요.

EcoRV에 의해 잘린다면 이는 T가 없는 EcoRV의 self ligate입니다. 이를 확인했으면 대량으로 키운 후 충분한 양의 plasmid를 얻고 이를 EcoRV로 많이 잘라 놓으세요.

(부연하여 말씀드리면 해당 TA vector는 EcoRV로 자른 blunt end에 Taq이나 또는 terminal transferase를 이용해 3'말단에 T를 붙인 것입니다. 따라서 blue colony는 원래의 lacz coding frame이 맞을 수밖에 없기 때문에 blue가 뜨고 EcoRV에 의해 잘릴 수 밖에 없습니다).

EcoRV로 자른 DNA에 Taq pol (A tailng기능이 있는)과 dTTP만을 넣고 72C 에서 1시간 정도 반응한 후 정제해서 사용하면 이것이 TA vector입니다.

Option이긴 하지만 가능한 self를 줄이기 위해 EcoRV를 처리한 DNA에 CIAP를 처리해주는 것도 좋습니다. (자세한 것은 인터넷에서도 쉽게 찾을 수 있을 겁니다).

위와같이 했을때 최소한 구입한 것 정도의 효율로 많은 양의 TA vector를 만들순 있지만.... 글쎄요, 저는 왜 TA vector를 많이들 사용하는지 잘 이해를 못해서.....

그리고 terminal transferase를 이용하거나 또는 3'T overhang을 만드는 XcmI이나 AhdI과 같은 restriction enzyme을 사용하는 방법도 있으며 이보다 백배는 효율이 더 좋은 Topoisomerase를 이용하는 방법도 조금만 자료를 찾아보면 그리 어렵지 않습니다. 20-50회에 수십만원하는 제품을 구입해 사용하는 것보다 조금마한 노력으로 자손만대까지 쓸수 있는 양을 그리 어렵지 않게 만들 수 있습니다.

알zipnine  |  2009.04.29   

오옷  사용했던 T-vector를 다시 사용할수 있는 방법이 있었군요..

엘피스님 덕분에 많은 것을 알게 되네요.

promega에서 T-vector를 주문해서 사용했는데. 20만원 정도. 최대 30~40회 정도 사용한것

같은데...

TOPO 방식도 작년 부터인가 카달로그를 들고 오면서 판촉을 하는걸 봤는데.

설명대로는 TA 보다 좋은것 같았습니다.

그런데 가격은 별 차이가 없어서. 20회에 20만원에 팔더군요.

해보진 않았는데...   지금은.. 사용해볼려고 합니다.

혹시 싸게 공급하는 곳을 아시면 ^^ 대리점 이름만 남겨주세요 ㅎ
(취직한 연구소에 클로닝 연구원는 저 뿐이라 ㅜㅜ 물어볼 곳도 없네요.)

cloning  |  2009.05.01    

엘피스님 감사합니다..

제가 실험이라고 첨 시작한게 cloning인데다가,

다른 방법이 얼마나 효율이 좋을지 확신이 안서서 그냥 lab에서 쓰던 걸 썼거든요.

알려주신 방법으로 잘 해봐야 겠어요~^^

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