브만사 인터뷰 한빛사 그 이후
2007년에 제가 콜로라도 주립대에서 post-doc으로 근무할 때 식물세포와 조류 (algae)세포의 골치체와 주변 vesicle을electron tomography를 사용해서 관찰한 연구가...
University of Florida, Assistant Professor 강병호 교수
- 현재의 근황
- 현 소속기관과 연구실/부서 소개
- 진행중인 연구분야 혹은 맡고 있는 업무 내용
- 과학기술인으로서 느낀 보람
- 학생들/후배들에게 전하고 싶은 점
- 앞으로의 계획과 바람
현재의 근황
2007년에 제가 콜로라도 주립대에서 post-doc으로 근무할 때 식물세포와 조류 (algae)세포의 골치체와 주변 vesicle을electron tomography를 사용해서 관찰한 연구가 한빛사에 소개되었습니다. 그때 조교수 자리에 지원하고 있었는데, 다행히 플로리다 주립대 미생물학과에 채용이 되어서, 2007년 여름부터 근무하고 있습니다. 조교수가 된 후 처음 2년동안은 뭘했는지도 기억이 잘 나지 않을 정도로 빠르게 지나갔습니다. 지금은 좀 자리가 잡힌 것 같습니다. 가끔 BRIC website에 가서 소개된 논문과 실험실에 관해 읽습니다. 친구나 만난 적이 있는 분의 소식을 읽으면, 반가워서 BRIC에서 봤다면서 전화나 이메일을 하기도 합니다.
현 소속과 연구실, 연구분야 소개
저희 실험실에서는 현미경기술과 분자생물학 기술을 사용하여 식물세포의 성장과 분화과정을 연구하고 있습니다. 동물과 마찬가지로 식물역시 다세포 진핵생물입니다. 식물 개체내에서는 세포들이 끊임없이 분열하고 분화하여 다양한 조직을 형성하고 유지해 나갑니다. 저희 연구의 주된 목적은 식물세포 분화에 관여하는 세포내 구조 변화와 이를 조절하는 유전자 조절 프로그램을 알아내는 것입니다.
여러가지 식물조직 중에서 저희는 옥수수 배젖 (maize endosperm)을 모델시스템으로 하여 연구를 수행하고 있습니다. 옥수수 배젖은 옥수수씨앗의 대부분을 구성하며 많은 양의 탄수화물과 단백질을 함하고 있어서 농업, 식품가공 산업, 바이오에너지 산업의 중요한 원료입니다. 이뿐 아니라 옥수수 배젖은 식물세포 분화 연구에 도움이 되는 장점들을 가지고 있습니다. 발달단계 초기에 동일했던 배젖 세포들이 위치에 따라 3종류의 다른세포들, 즉 transfer cell, aleurone cell, starchy endosperm cell로 분화합니다. 이 세 종류의 세포들이 각각 다른 조직을 형성하는데, 단일 조직내에는 한 가지 세포만 균일하게 존재합니다. 게다가 조직안에서 세포 분화과정이 동시에 진행됩니다. 그러므로 특정 분화단계에 있는 한 종류의 세포를 비교적 깨끗하게 분리해 낼 수 있습니다. 이 샘플로부터 핵산, 염색질, 단백질등을 정제, 분석하여 어떤 유전자들이 특정 조직의 분화 단계에서 많이 발현되며 이 유전자 발현에 어떤 단백질이 관여하는지 연구하고 있습니다 (그림 참조). 최근에는 염색질 구조 변화을 통한 유전자 활성 조절메카니즘을 살펴보고 있습니다. (염색질 구조 변화 연구는 텍사스 주립대 성시범 박사와 공동으로 수행중입니다.)
식물을 분자생물학 관점에서 연구하기는 Arabidopsis가 가장 수월합니다. 하지만 옥수수 genome sequencing이 거의 완료되었고, 옥수수 sequence database의 오류가 빠른 속도로 수정되고 있습니다. Bioinformatics tools, transposon mutant lines 및 형질전환기술들도 속속 개량되고 있어서 앞으로 많은 연구들이 좀 더 쉽게 진행되리라고 생각됩니다.
이 밖에도 저희 연구실에서는Arabidopsis mutants/transformants를 이용한 식물 유전자의 기능적 연구, 전자현미경을 사용한 단백질 위치 지정, 그리고 플로리다 오렌지나무에 기생하며 질병을 일으키는 박테리아의 병리 메카니즘에 관한 연구도 하고 있습니다.
같은 길을 걸어가는 학생들/후배들에게 전하고 싶은 말씀?
새로운 연구기술이 개발됨에 따라 혹은 새로운 paradigm이 대두됨에 따라 생물학분야는 끊임없이 변화합니다. 최근에는 변화 주기가 더 빨라진 것 같습니다. 자신의 분야에 획기적인 연구방법이 새로 개발되었다면 그 연구방법에 빨리 익숙해져야 뒤쳐지지 않습니다. 그리고 기존 dogma에 집착하지 않고 새로운 idea를 중립적으로 검증하는 것도 중요하다고 생각합니다.
연구실 홍보
제 실험실에 ion torrent personal genome machine와 TF20 200KV cryo-transmission electron microscope가 곧 설치됩니다. Personal genome machine은 일종의 next-generation parallel sequencer로서, 10~100 mega-base base pair DNA sequence를 2~4시간만에 읽어 낼 수 있습니다. Transcriptome analysis, DNA methylation, chromatin immuno-precipitation sequencing 연구에 활용할 예정입니다. TF20 전자현미경으로는 샘플에 강력한 전자빔을 쏘아서electron tomography, single particle analysis에 적합한 전자현미경 사진들을 찍을 수 있습니다. 이 사진들로부터 세포내 소기관, 바이러스, macromolecule의 3차원 구조를 sub-nanometer resolution으로 알아내어 이들이 포내에서 어떤 메카니즘으로 작동하는지 연구할 계획입니다.
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