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BioLab 김한준 교수
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김동완
김동완 (Dongwan Kim) 저자 이메일 보기
서울대학교, 기초과학연구원
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The Architecture of SARS-CoV-2 Transcriptome
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Abstract

SARS-CoV-2 is a betacoronavirus responsible for the COVID-19 pandemic. Although the SARS-CoV-2 genome was reported recently, its transcriptomic architecture is unknown. Utilizing two complementary sequencing techniques, we present a high-resolution map of the SARS-CoV-2 transcriptome and epitranscriptome. DNA nanoball sequencing shows that the transcriptome is highly complex owing to numerous discontinuous transcription events. In addition to the canonical genomic and 9 subgenomic RNAs, SARS-CoV-2 produces transcripts encoding unknown ORFs with fusion, deletion, and/or frameshift. Using nanopore direct RNA sequencing, we further find at least 41 RNA modification sites on viral transcripts, with the most frequent motif, AAGAA. Modified RNAs have shorter poly(A) tails than unmodified RNAs, suggesting a link between the modification and the 3′ tail. Functional investigation of the unknown transcripts and RNA modifications discovered in this study will open new directions to our understanding of the life cycle and pathogenicity of SARS-CoV-2.

논문정보
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2020년 선정
| F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2020년 04월 (BRIC 등록일 2020-10-23)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Cell_Biology, Biochemistry, Molecular_Biology
- 피인용횟수: 최근 3년간 60회 이상 인용된 논문
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