[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 농수식품
엘앤씨바이오
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
시스템 점검 : 12월 1일 목요일 오후 10시
전체보기 농림성과 식품성과 인터뷰
이재성
이재성 (Jae-Seong Lee) 저자 이메일 보기
성균관대학교
저자CV 보기
623 KB
 
조회 507  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
The freshwater water flea Daphnia magna NIES strain genome as a resource for CRISPR/Cas9 gene targeting: The glutathione S-transferase omega 2 gene
열기 Authors and Affiliations

Abstract

The water flea Daphnia magna is a small freshwater planktonic animal in the Cladocera. In this study, we assembled the genome of the D. magna NIES strain, which is widely used for gene targeting but has no reported genome. We used the long-read sequenced data of the Oxford nanopore sequencing tool for assembly. Using 3,231 genetic markers, the draft genome of the D. magna NIES strain was built into ten linkage groups (LGs) with 483 unanchored contigs, comprising a genome size of 173.47 Mb. The N50 value of the genome was 12.54 Mb and the benchmarking universal single-copy ortholog value was 98.8%. Repeat elements in the D. magna NIES genome were 40.8%, which was larger than other Daphnia spp. In the D. magna NIES genome, 15,684 genes were functionally annotated. To assess the genome of the D. magna NIES strain for CRISPR/Cas9 gene targeting, we selected glutathione S-transferase omega 2 (GST-O2), which is an important gene for the biotransformation of arsenic in aquatic organisms, and targeted it with an efficient make-up (25.0%) of mutant lines. In addition, we measured reactive oxygen species and antioxidant enzymatic activity between wild type and a mutant of the GST-O2 targeted D. magna NIES strain in response to arsenic. In this study, we present the genome of the D. magna NIES strain using GST-O2 as an example of gene targeting, which will contribute to the construction of deletion mutants by CRISPR/Cas9 technology.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2021년 11월 (BRIC 등록일 2021-11-12)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진 태극기
- 분야: Marine_Biology
  댓글 0
등록
 
목록
※ 농수식품은 향후 서비스 종료 예정으로, 2022년 7월 1일 이후에는 업데이트 되지 않습니다. 더 나은 서비스를 제공하기 위하여 다양한 시도 중이니 많은 관심 부탁드립니다.
외부관련링크
ORCID ORCID 0000-0003-0944-5172
Scopus Scopus Author Identifier 57201265245
Publons ResearcherID H-6013-2015
Google Scholar
PubMed
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
In vivo specific imaging technique : Chamber & Windows Application in animal model
[POSTECH] 2023학년도 융합대학원 의과학전공 봄학기 신입생 모집
바이오QC 실무과정 14기 모집
바이오QC 실무과정 14기 모집
사전접수: ~2022.12.09
날짜: 2022.11.14~12.09
장소: 경기 성남시 분당구 황새울로 329번길 5
2022 바이오·제약 인천 글로벌 콘펙스
2022 바이오·제약 인천 글로벌 콘펙스
사전접수: ~2022.11.29
날짜: 2022.11.30~12.02
장소: 송도컨벤시아
2023년 STAEM연구사업(과학난제도전융합연구개발) 기술수요조사 실시
2023년 STAEM연구사업(과학난제도전융합연구개발) 기술수요조사 실시
날짜: 2022.11.30
주관: 국가과학난제도전협력지원단
[싸이티바] 2023 바이오 트렌드 서밋 - With you from discovery to delivery
[싸이티바] 2023 바이오 트렌드 서밋 - With you from discovery to delivery
사전접수: ~2022.11.15
날짜: 2022.11.16~17
장소: 그래비티 호텔 판교 B1 스페이스 볼룸
[전액무료]11월/12월 재직자 대상 직무능력 향상교육 참여 교육생 모집(의약품ㆍ화장품ㆍ분석기기 활용)
[전액무료]11월/12월 재직자 대상 직무능력 향상교육 참여 교육생 모집(의약품ㆍ화장품ㆍ분석기기 활용)
날짜: 2022.10.17~12.16
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송생명1로 194-25, 청주SB플라자
 
위로가기
농수식품 홈
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
필코리아테크놀로지 광고