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[학술] inhibitor IC50값 구하는 방법
회원작성글 Labtor(대학생)
  (2023-03-26 15:40)

안녕하세요. 현재 inhibitor compound로 inhibition 관련 assay를 한 후 IC50값을 구했는데 방법이 맞는지 확신이 없어서 질문드립니다!

농도는 0(control)을 포함해서 총 4가지 농도로 진행하였는데 이게 선형 추세선을 그으면 R^2=0.3691이 나와서 정확도가 많이 떨어지더라구요...계산되는 IC50값도 눈으로 보이는 그래프랑 많이 다르구요!ㅜ

그래서 로그 추세선을 그렸는데 로그 함수는 0을 포함시킬 수가 없어서 control을 뺀 나머지 농도값 3가지로 로그 추체선을 그렸더니 R^2=0.998이 나오고 계산된 IC50값도 눈으로 그래프를 봤을 때랑 아주 비슷하게 나옵니다. 

 

결론적으로 control (0uM : 0% inhibition)을 제외한 나머지 test 농도값 3가지에 대한 inhibition rate으로 로그 추세선을 그려서 IC50값을 계산했는데 해당 방법이 방법적으로 옳은건지 여쭤보고 싶습니다..!



태그  #IC50   #로그함수
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  댓글 1  
회원작성글 TPD(과기인)  (2023-03-27 09:36)
1
일반적으로 Four parameter logistic model을 사용하여 구합니다. DMSO control은 Dose point에 포함되지 않습니다. 즉, 지금 수행하신 결과는 Dose point 3개에 대해 값을 구한 것입니다. 정확한 IC50을 구하려면 dose-point를 늘려서(6개 이상, 보통 8~10point를 많이 사용합니다.) 결과를 얻으시길 권합니다.

https://www.graphpad.com/guides/prism/latest/curve-fitting/reg_dr_inhibit_variable.htm
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