코돈 최적화는 유전자를 heterologous (다른 숙주에서) 발현할 때, 유전자를 클로닝할 때 문제가 발생하는 경우, 또는 유전자 발현 레벨을 최적화할 때 유용한 도구입니다. VectorBuilder의 코돈 최적화 도구는 Design Studio 에 내장되어 있으며, 여기에서 독립적으로도 사용할 수 있습니다.

대부분의 아미노산은 여러 코돈에서 번역될 수 있지만, 코돈 편향은 하나의 코돈이 다른 코돈보다 선호도를 반영하며 이는 종 마다 다릅니다. 이것은 한 유전자가 다른 숙주 종에서 번역이 감소될 수 있습니다. 이 도구는 숙주 유기체의 코돈 편향을 활용하여 더 높은 효율로 동일한 아미노산 서열을 생성하여 codon adaptation index (CAI)를 최적화할 수 있습니다.

코돈 최적화는 관심 유전자의 클로닝 효율을 향상시키기 위해 사용될 수 있습니다. 이 도구는 GC 함량 및 반복 서열을 최적화하고, mRNA 안정성을 개선하고, 제한효소 인식 부위를 회피함으로써 전사 또는 번역 효율을 개선하는데 도움이 될 수 있습니다.

1. Optimizing sequences for codon usage in desired target species

2. Optimizing sequences with high GC content

3. Optimizing sequences with repetitive regions

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