|
|
|
|
| 6,542건 |
정확도순 ㅣ 날짜순
|
| Q. 16S rDNA sequence 중에서 특이적 primer를 제작하려면 |
| 16S ribosomal RNA gene)인 미생물 sequence 중에서 특이적 primer를 제작하려면 어떻게 해야 하나요?
1 agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac
61 ggcagcacgg gagcaatcct ggtggcgagt ggcgaacggg tgagtaatat atcggaacgt
121 ... |
| A.
일단 20bp정도 사이즈의 55도 정도의 anneal temp을 갖는 primer가 좋습니다.
alignment가 이미되어진 file이 RDP에도 제공되어지니 이를 이용해도 되고 ARB에 사용되는 DB를 이용해도 되고 Phydit에 제공되어지는 ... |
|
답변 3 | 2005.09.08 |
|
| Q. cloning 진행중 primer 문제 |
|
restriction emzyme은 프로그램을 통해 BamHI과 XhoI을 선택하였고
primer는 각각
F AT GGATCC ATGGCCAACA Tm 53.7ºC
R AGG CTCGAG CTAACTGATGATCT Tm 55.2ºC
이렇게 제작하였습니다.
헌데 자꾸 dimer처럼 100bp 아래쪽에 짙은 밴드만 ... |
| A. 지금까지 한 것이 아깝긴 할 것입니다만, 미련을 버리시고 바로 더 긴 primer를 합성하시는 것이 좋겠습니다 ... |
|
답변 5 | 2014.08.06 |
|
| Q. primer제작 조건중.. |
| 잘 안가네요.
target sequence에 대해 primer를 짤때 sense, antisense primer모두 3번 끝은 target sequence와 상보적인 염기로 하지 않아야 한다는 것인가요?
오히려 상보적이어야 하는거 아닌지요?
이렇게 하는게 ... |
| A. 즉 두 primer간에 3''-end에서 유사서열이 있어 base paring이 되면 primer dimer가 생성될 수 있다는 의미입니다 ... |
|
답변 2 | 2008.04.19 |
|
| Q. sequencing primer짤때요 |
| A라는 gene의 sequence를 보려고 하는데요
sequencing primer를 짜려고 합니다.
보려고하는 gene sequenc에서 얼마나 앞에서부터 짜면 되나요?
제가 해본적이 없어서요.. 한~앞뒤로 300bp에서부터 짜면 되나요? ... |
| A. 잘 읽히지 않은 gene의 후반부를 읽어주면 됩니다. reverse primer로 sequencing을 할 경우 보라색 부분의 gene의 처음부분이 되니까 제대로 읽어줄 수 있습니다 ... |
|
답변 3 | 2012.08.31 |
|
| Q. primer 짜는데 primer blast와 primer 3 |
| 되는 것을 사용해도 잘 되나요??
그리고 primer 3를 이용하여 primer를 고르면 GC contents는 45-50%로 나오는데, 대신 product size가 대부분이 200bp 근방이더라구요, 저는 priduct size를 400-700사이로 잡고 싶은데, ... |
| A. Primer3는 조건별 check-box가 있습니다. 여기서 조건을 바꿔주면 그조건에 따라 유연성있게 primer를 골 ... 처음부터 좋은 primer를 디자인하는 것이 더 편합니다. Primer 디자인 PCR성공의 95%를 좌우합니다 ... |
|
답변 1 | 2012.06.30 |
|
| Q. primer design좀 도와주세요.. |
| primer를 찾으려고 했는데
GC content값이 넘 높아... 적당한 primer를 찾을수 없다고 나오네요...
그래서 제가 사용하는 ABI 회사에 전화를 했더니....
다른 program으로 돌려봤더니...taqman으로 하면 tamra도 안되고 ... |
| A. 합니다.
님께서 보시고 Tm 이 약 60-65 정도 되는 위치에 primer를 선택하심이 좋을듯 하네요
예를 들어 님의 sequence중에 GTA ATC CTT GCT TTT GTC GCC ACG forward로 선택을 하신다면 basic Tm 이 57도, GC content는 50%가 ... |
|
답변 1 | 2006.04.24 |
|
| Q. primer 주문 제작할때요... |
| ?
제가 primer 주문을할려고하는데요..
synthesis scale을 주로 0.02로 주문해야하는데...
size가 좀 크다고 0.05로 주문을 햇습니다..
여기서 올때 100pmoles/ul로 오는데..
20pmoles/ul로 만들려고하는데요.. 이때 TE를 ... |
| A. 0.02 나 0.05나 scale일 뿐입니다. 결론 적으로 말씀드리자면, 100pmol에 대한 volume을 primer tube에 적어서 보내 줍니다. 따라서 기존에 하시던 대로 하시면 될 것 같습니다. |
|
답변 1 | 2015.03.01 |
|
| Q. primer 이렇게 짜도 되나요? |
| 않을까 싶어서요. 이런부분에 대해 설명돼있는 곳도 없고 primer 주문하는거도 막하기 어려운지라 ㅠㅠ
혹시 이런부분 잘 아시는분 있으면 답변 부탁드립니다!! ... |
| A. 6개 정도로 이상해지지 않습니다~ |
|
답변 2 | 2015.08.31 |
|
| Q. primer 짜는법 |
| 29mer)
R : AATCCTGTGGCAGCAG(16mer)
총 product size는 123bp입니다.
위의 primer로 pcr이 제대로 이루어질까요?
forward와 reverse의 mer차이가 너무 심하게 나서요.
경험있으신 선생님들 의견좀 주세요. ... |
| A. forward와 reverse primer의 mer수에 따라 PCR이 이루어 지거나 이루어지지 않는다거나 판단할 수 없습니다.
구 ... 용도에 맞추어 Tm까지 고려하여 디자인하신다면 이미 primer 디자인을 마스터 하신겁니다 ... |
|
답변 1 | 2015.05.07 |
|
| Q. isoform까지 잡는 primer |
| 궁금한점이 있어서요...
논문을 보다 보니..
isofrom까지 잡는 primer가 있더라구요...
혹시..
어떻게 짜는지 아시는 분 계신지...
아님 그렇게 짜 주는 프로그램같은게 상용화되어 있는게
있는지...
안 ... |
| A. 없어져 B form이 만들어 지는 경우라면 중첩되는 부분에서 primer 를 잡으시면 됩니다.
PCR을 돌리면 A form은 300bp, B form은 200bp의 product이 동시에 나오게 됩니다.
A form만 있는 cell이라면 당연히 300bp의 PCR ... |
|
답변 1 | 2004.07.27 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| [공지] 한국연구재단 검색은 해당 시스템 종료로 인해 서비스 종료되었습니다. |
|
|
|
|
|
